161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2924 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  100 
 
 
231 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  70.28 
 
 
237 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  48.87 
 
 
240 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  41.55 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  41.55 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  40.91 
 
 
221 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 
229 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  41.59 
 
 
215 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  40.28 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  37.73 
 
 
240 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  37.73 
 
 
240 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  37.73 
 
 
240 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  37.5 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  36.71 
 
 
216 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  36.06 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  36.06 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  40 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 
234 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  35 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  34.7 
 
 
217 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  33.49 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  33.48 
 
 
218 aa  118  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  44.62 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  33 
 
 
218 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  33.8 
 
 
228 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  45.74 
 
 
133 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  33.18 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  31.3 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  30.91 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  42.42 
 
 
243 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  31.31 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.33 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  38.35 
 
 
221 aa  92.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  30.77 
 
 
234 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  32.51 
 
 
209 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  29.41 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  34.27 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.12 
 
 
215 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  29.87 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  30.12 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  29.95 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  29.23 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.11 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  31.5 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  24.27 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  36.04 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  30.95 
 
 
201 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.06 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  27.2 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  27.15 
 
 
219 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.95 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  34.53 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  25.52 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.82 
 
 
149 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  30.17 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  24.15 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  34.35 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0668  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.5 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.396258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  25 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  24.75 
 
 
213 aa  52  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  22.46 
 
 
229 aa  52  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3151  Repressor lexA  28.68 
 
 
154 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.662921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  30.6 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  32 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  35.96 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0077  phage repressor like transcriptional regulator  26.17 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  26.5 
 
 
239 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  27.94 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2520  LexA repressor  33.87 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0774546  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  37.84 
 
 
210 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  33.86 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  23.61 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  36.36 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  36.36 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  36.36 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.13 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.49 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.62 
 
 
243 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  36.49 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  34.43 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  33.78 
 
 
210 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  34.48 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.6 
 
 
217 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.18 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  36.49 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.32 
 
 
200 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2142  LexA repressor  27.52 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  35.23 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  29.14 
 
 
217 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  28.65 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  35.71 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  35.23 
 
 
232 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.39 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  33.33 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.33 
 
 
158 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  33.07 
 
 
143 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 
227 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>