11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2910 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2910  late antiterminator  100 
 
 		 162 aa  338  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000906768  hitchhiker  0.0000000000646478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1025  putative antitermination protein  46.45 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0629  gp23  66.67 
 
 		 45 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000566735  normal  0.0550945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3220  antitermination protein Q  32.91 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0931001  hitchhiker  0.00440556 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01528  antitermination protein Q-like protein from lambdoid prophage DLP12  32.91 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.38987  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1649  phage antitermination Q  32.91 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000915979  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01522  hypothetical protein  32.91 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2152  phage antitermination Q type 1 family  32.91 
 
 		 126 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00502  predicted antitermination protein  30 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238251  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0823  phage antitermination Q  30 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.107592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00507  hypothetical protein  30 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.22815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>