298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2820 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1678  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  7.5386e-11  normal  0.180154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2220  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.22834e-05  normal  0.473554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1135  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.55907e-09  hitchhiker  5.76998e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1138  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.3435e-10  hitchhiker  3.16905e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1140  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.9643e-10  hitchhiker  1.18224e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2167  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.4435e-06  normal  0.244558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4241  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.07501e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4240  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  6.48867e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4235  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000287726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1689  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  3.9429e-11  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1147  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.75787e-11  hitchhiker  1.60242e-14 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2820  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  8.47823e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0700  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.46512e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0701  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.00783e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0768  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.85635e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2828  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  9.475e-10  normal  0.641143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2830  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  7.81993e-10  normal  0.665303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4673  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.54292e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4674  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.04285e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2105  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  6.27043e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2115  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  3.35092e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2067  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.48141e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2172  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000152645  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0877  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.09556e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2304  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  2.13105e-05  hitchhiker  2.5e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2165  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  4.02737e-08  normal  0.996727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2834  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.58247e-07  normal  0.787157 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2163  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.49839e-08  normal  0.522468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4675  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.10432e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4676  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.2992e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2222  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00135486  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2117  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.10922e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2101  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.10399e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2234  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.37279e-05  normal  0.643353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2170  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.464864  normal  0.318771 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2182  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.20944e-06  normal  0.975186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2184  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00931098  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2236  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0760667  normal  0.274847 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2347  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  4.05542e-06  hitchhiker  0.00383483 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2349  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  3.65984e-05  hitchhiker  0.00169807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2170  tRNA-Asn  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  3.82862e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0067  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.057405  normal  0.869795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0070  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.263184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0068  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0069  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  3.87596e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0058  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0045  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.79772e-09  normal  0.0321214 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0044  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000371151  hitchhiker  0.00258348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0026  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.332926  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0025  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.253153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5044  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.06715e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5043  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.44379e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0056  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0053  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100848  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0054  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020745  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0055  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0679012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0047  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.044997  normal  0.297586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0046  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  7.33647e-08  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5041  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.17093e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5042  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  4.64951e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0024  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.131975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00033  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.15515e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0034  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.685825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0049  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0047  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0046  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.426184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0039  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.227899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0059  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0044  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0053  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.593082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0041  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.08298e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0040  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00034  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00035  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0182063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00036  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00807096  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0039  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  5.83297e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0040  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.09411e-14  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0486048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0033  tRNA-Asn  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.240758  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0421  tRNA-Asn  98.67 
 
 
76 bp  141  3e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.747213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0075  tRNA-Asn  98.61 
 
 
76 bp  135  2e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  2.18117e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t080  tRNA-Asn  97.26 
 
 
76 bp  129  1e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.27089e-11  normal  0.640571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t078  tRNA-Asn  97.26 
 
 
76 bp  129  1e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.16126e-11  normal  0.643909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0051  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.57553e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0050  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.74224e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0049  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.96126e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t082  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.11549e-11  normal  0.635304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t081  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.29685e-11  normal  0.647259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0052  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.13258e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t079  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.10415e-11  normal  0.651496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0053  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.54506e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0054  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.90544e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0053  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.95579e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0053  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.03697e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0051  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.73261e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0063  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.73175e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0062  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.00655e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0061  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.04416e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0065  tRNA-Asn  97.22 
 
 
76 bp  127  4e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.02168e-07  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>