21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2729 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1696  conserved hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.26362e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2729  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.73334e-09  normal  0.499311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1075  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.79969e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1232  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.34159e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1690  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.11626e-08  hitchhiker  0.00184343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2185  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.92703e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2052  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  129  1e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.13638e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2142  hypothetical protein  98.39 
 
 
65 aa  128  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000250627  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1258  hypothetical protein  98.39 
 
 
65 aa  128  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00498936  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1136  hypothetical protein  98.39 
 
 
65 aa  128  2e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.07379e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2200  hypothetical protein  98.39 
 
 
64 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.753723 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2146  hypothetical protein  98.39 
 
 
64 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00313167  hitchhiker  0.00464128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2543  hypothetical protein  91.94 
 
 
62 aa  119  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000198057  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1630  hypothetical protein  83.05 
 
 
63 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2833  hypothetical protein  83.05 
 
 
63 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0649641  normal  0.378732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1741  hypothetical protein  82.76 
 
 
63 aa  100  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.261253  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2618  hypothetical protein  72.88 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1848  hypothetical protein  74.58 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.768315  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3051  hypothetical protein  72.88 
 
 
71 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1506  hypothetical protein  71.19 
 
 
63 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425552  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1534  hypothetical protein  67.8 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.898397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>