85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2564 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2564  putative solute/DNA competence effector  100 
 
 
232 aa  473  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  5.84376e-09  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01802  putative solute/DNA competence effector  99.57 
 
 
232 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2099  putative solute/DNA competence effector  99.14 
 
 
232 aa  470  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.16503e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1356  putative solute/DNA competence effector  99.57 
 
 
232 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  1.20043e-08  normal  0.2491 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01790  hypothetical protein  99.57 
 
 
232 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1801  putative solute/DNA competence effector  99.57 
 
 
232 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.304179  normal  0.0872497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1922  putative solute/DNA competence effector  99.57 
 
 
232 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.31825e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1811  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  99.14 
 
 
232 aa  470  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.179036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2060  putative solute/DNA competence effector  99.14 
 
 
232 aa  468  1e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.98248e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1985  putative solute/DNA competence effector  92.24 
 
 
228 aa  397  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000228326  hitchhiker  0.0069158 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2047  putative solute/DNA competence effector  92.67 
 
 
228 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.24524  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1989  putative solute/DNA competence effector  92.67 
 
 
228 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00261686  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1285  putative solute/DNA competence effector  92.67 
 
 
228 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  5.38186e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1469  putative solute/DNA competence effector  92.67 
 
 
228 aa  399  1e-110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00111252  normal  0.239206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2401  putative solute/DNA competence effector  86.7 
 
 
227 aa  380  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1671  putative solute/DNA competence effector  73.88 
 
 
237 aa  330  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.4891e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1782  putative solute/DNA competence effector  73.88 
 
 
237 aa  330  9e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0742372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2664  putative solute/DNA competence effector  73.88 
 
 
237 aa  330  9e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.64643e-10  normal  0.0215757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2118  putative solute/DNA competence effector  70.61 
 
 
236 aa  318  4e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00110468  hitchhiker  6.59128e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1844  putative solute/DNA competence effector  67.07 
 
 
243 aa  315  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.790888  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2140  putative solute/DNA competence effector  65.1 
 
 
252 aa  302  4e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1852  putative solute/DNA competence effector  63.46 
 
 
252 aa  298  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1543  putative solute/DNA competence effector  52.36 
 
 
210 aa  229  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1105  putative solute/DNA competence effector  53.48 
 
 
208 aa  229  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  9.47436e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003430  ProQ protein  52.84 
 
 
208 aa  221  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  4.70709e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02347  putative solute/DNA competence effector  50.66 
 
 
220 aa  219  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1584  putative solute/DNA competence effector  42.49 
 
 
219 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1934  putative solute/DNA competence effector  40.95 
 
 
212 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.854531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1992  putative solute/DNA competence effector  42.24 
 
 
216 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1801  putative solute/DNA competence effector  42.24 
 
 
215 aa  172  6e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925744  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2602  putative solute/DNA competence effector  40.09 
 
 
213 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02001  putative solute/DNA competence effector  42.98 
 
 
222 aa  168  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2203  putative solute/DNA competence effector  37.66 
 
 
213 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.702868  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1721  putative solute/DNA competence effector  40.09 
 
 
228 aa  166  3e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  5.11987e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1070  putative solute/DNA competence effector  44.16 
 
 
211 aa  165  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.265506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2229  putative solute/DNA competence effector  40.52 
 
 
203 aa  163  2e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.180207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2132  putative solute/DNA competence effector  40.17 
 
 
214 aa  163  2e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.62228e-06  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2484  putative solute/DNA competence effector  40.09 
 
 
217 aa  163  2e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.95377e-08  normal  0.223616 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2561  putative solute/DNA competence effector  38.79 
 
 
209 aa  155  5e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  normal  0.0763092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2188  putative solute/DNA competence effector  40.09 
 
 
207 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal  0.724108 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2811  putative solute/DNA competence effector  35.34 
 
 
220 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00532714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1903  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 
209 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0351843  normal  0.135941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2441  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 
210 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.254744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2448  putative solute/DNA competence effector  39.22 
 
 
210 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1672  putative solute/DNA competence effector  58.88 
 
 
214 aa  145  4e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  3.66609e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1747  putative solute/DNA competence effector  58.88 
 
 
214 aa  145  4e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.144322  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1777  putative solute/DNA competence effector  58.88 
 
 
214 aa  145  4e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.205752  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2274  Fertility inhibition FinO-like protein  32.41 
 
 
260 aa  68.6  7e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1663  hypothetical protein  35.65 
 
 
121 aa  65.5  7e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1657  hypothetical protein  35.65 
 
 
123 aa  65.5  7e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0754  ProP effector  35.58 
 
 
119 aa  62.8  5e-09  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1323  ProP effector  34.96 
 
 
171 aa  62.4  6e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.929512  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0133  hypothetical protein  35.54 
 
 
230 aa  62  8e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0169  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  43.37 
 
 
289 aa  61.6  9e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0459261  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0187  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  43.37 
 
 
289 aa  61.2  1e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0862  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  41.05 
 
 
295 aa  61.6  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0148  hypothetical protein  37.36 
 
 
230 aa  60.5  2e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1492  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.94 
 
 
222 aa  60.8  2e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1540  ProP effector  37.38 
 
 
183 aa  60.5  2e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1453  ProP effector  37.38 
 
 
179 aa  60.5  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2080  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  36.7 
 
 
284 aa  60.8  2e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0898874  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0041  ProQ protein  37.38 
 
 
200 aa  59.3  4e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3139  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  37.65 
 
 
152 aa  58.5  9e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144488  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2177  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  36.27 
 
 
251 aa  58.2  1e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0121  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  57.8  1e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0127527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2570  hypothetical protein  38.54 
 
 
253 aa  56.6  4e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000198661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0245  hypothetical protein  43.37 
 
 
319 aa  54.7  1e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2615  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.71 
 
 
178 aa  55.1  1e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1033  hypothetical protein  38.55 
 
 
239 aa  53.9  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0842196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3812  activator of osmoprotectant transporter  36.97 
 
 
228 aa  53.5  3e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4697  ProQ family protein  36.26 
 
 
114 aa  53.1  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3447  hypothetical protein  39.77 
 
 
279 aa  53.1  4e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  34.07 
 
 
218 aa  52.8  5e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6155  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  33.33 
 
 
398 aa  52  7e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168417  normal  0.179511 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6008  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  34.44 
 
 
284 aa  52  7e-06  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5764  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  34.44 
 
 
224 aa  52  8e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.933198 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8137  hypothetical protein  39.39 
 
 
144 aa  52  9e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0182  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  38.36 
 
 
138 aa  50.8  2e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.247211  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0307  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  37.93 
 
 
288 aa  50.4  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406422  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5820  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  35 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231664  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6185  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  35 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.942163  normal  0.876638 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7730  ProQ, activator of osmoprotectant transporter ProP  35 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6664  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  35.44 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0034  hypothetical protein  36.84 
 
 
200 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00139041  normal  0.0848547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3083  ProQ activator of osmoprotectant transporter ProP  26.32 
 
 
169 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>