More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2544 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  99.06 
 
 
532 aa  1078    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  76.42 
 
 
460 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  99.06 
 
 
532 aa  1078    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  99.06 
 
 
532 aa  1078    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  69.36 
 
 
532 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  75.42 
 
 
474 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  76.08 
 
 
533 aa  818    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  99.06 
 
 
532 aa  1078    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  100 
 
 
532 aa  1090    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  75.52 
 
 
533 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  75.52 
 
 
533 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  98.12 
 
 
532 aa  1070    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2076  hypothetical protein  97.23 
 
 
254 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  43.36 
 
 
538 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  32.37 
 
 
511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  35.17 
 
 
521 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  32.44 
 
 
535 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  33.4 
 
 
523 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  29.73 
 
 
518 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  29.73 
 
 
518 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  29.73 
 
 
518 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  29.73 
 
 
518 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  30.48 
 
 
518 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  32.03 
 
 
518 aa  224  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
520 aa  223  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  28.35 
 
 
518 aa  223  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  28.35 
 
 
518 aa  223  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  28.35 
 
 
518 aa  223  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  28.46 
 
 
518 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  28.46 
 
 
518 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  28.46 
 
 
518 aa  221  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  28.16 
 
 
518 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  28.16 
 
 
518 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  30.28 
 
 
497 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  29.19 
 
 
528 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  33.26 
 
 
528 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  34.26 
 
 
506 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  28.38 
 
 
534 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  34.03 
 
 
506 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  31.43 
 
 
526 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  33.8 
 
 
506 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  33.56 
 
 
506 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  34.34 
 
 
515 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  32.01 
 
 
506 aa  207  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  43.4 
 
 
519 aa  207  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  33.27 
 
 
528 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  29.12 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  32.93 
 
 
528 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  29.12 
 
 
526 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2501  diguanylate phosphodiesterase  34.45 
 
 
528 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0965221  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  29.92 
 
 
534 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  29.92 
 
 
534 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  29.92 
 
 
534 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  29.42 
 
 
504 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.57 
 
 
516 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  30.79 
 
 
516 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  30.57 
 
 
516 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  31 
 
 
516 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  28.96 
 
 
500 aa  194  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.57 
 
 
516 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  32.63 
 
 
514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  28.28 
 
 
501 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  29.56 
 
 
512 aa  186  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5257  diguanylate phosphodiesterase  28.69 
 
 
588 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0193629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  28.52 
 
 
537 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  27.68 
 
 
546 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2992  diguanylate phosphodiesterase  28.71 
 
 
522 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.44 
 
 
521 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  27.44 
 
 
521 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  28.17 
 
 
507 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0378  LuxR-family transcriptional regulator/cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.68 
 
 
362 aa  171  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  28.17 
 
 
507 aa  171  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  27.44 
 
 
521 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  36.18 
 
 
530 aa  170  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5086  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 
546 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  27.26 
 
 
521 aa  170  8e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0333  LuxR-family transcriptional regulator  39.27 
 
 
362 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0346  LuxR-family transcriptional regulator  39.27 
 
 
362 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  36.51 
 
 
525 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0375  LuxR-family transcriptional regulator  39.27 
 
 
362 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00271  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.27 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3291  diguanylate phosphodiesterase  39.27 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.6 
 
 
1120 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0510  hypothetical protein  37.86 
 
 
701 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0522945 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00274  hypothetical protein  39.27 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3308  diguanylate phosphodiesterase  39.27 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4552  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.43 
 
 
624 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  29.3 
 
 
486 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.29 
 
 
1484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.978359  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0401  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with MHYT sensor  37.55 
 
 
687 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.465852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.9 
 
 
862 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  29.03 
 
 
538 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6267  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.51 
 
 
693 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.57074  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6743  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.51 
 
 
693 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2742  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.6 
 
 
894 aa  162  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49140  GGDEF domain protein  39.83 
 
 
689 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0868  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.6 
 
 
743 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0386  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.55 
 
 
685 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7110  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.65 
 
 
694 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0633557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2223  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.08 
 
 
725 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.847933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>