28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2381 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  98.88 
 
 
534 aa  1092    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  98.69 
 
 
534 aa  1088    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  98.69 
 
 
534 aa  1088    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000030745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1108    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000071971  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  98.88 
 
 
534 aa  1092    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  69.66 
 
 
536 aa  785    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  98.88 
 
 
534 aa  1092    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  52.5 
 
 
534 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  52.4 
 
 
534 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  26.75 
 
 
572 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  27.04 
 
 
578 aa  183  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  29.05 
 
 
582 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1868  FAD dependent oxidoreductase  98.82 
 
 
85 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.189334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  25.78 
 
 
580 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  26.72 
 
 
506 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  23.64 
 
 
507 aa  54.7  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  22.01 
 
 
494 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  22.92 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  24.43 
 
 
445 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  24.21 
 
 
444 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  24.83 
 
 
474 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  25.82 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.86 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.81 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.81 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.57 
 
 
1072 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  30.77 
 
 
624 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  23.01 
 
 
474 aa  43.9  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>