17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2359 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1993  aldo/keto reductase  98.34 
 
 		 897 bp  1453    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748475  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01607  hypothetical protein  98.34 
 
 		 897 bp  1453    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000961998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2359    100 
 
 		 789 bp  1564    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000110536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1839  oxidoreductase YdhF  98.22 
 
 		 897 bp  1445    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1551  oxidoreductase YdhF  98.73 
 
 		 897 bp  1481    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0142361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1982  aldo/keto reductase  98.22 
 
 		 897 bp  1445    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00479924  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1858  oxidoreductase YdhF  98.09 
 
 		 897 bp  1437    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0852193  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1724  oxidoreductase YdhF  98.34 
 
 		 897 bp  1453    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01617  predicted oxidoreductase  98.34 
 
 		 897 bp  1453    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000132879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1800  aldo/keto reductase  80.7 
 
 		 897 bp  311  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000028572  normal  0.0307489 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1904  oxidoreductase YdhF  79.8 
 
 		 897 bp  299  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1735  oxidoreductase YdhF  79.67 
 
 		 897 bp  291  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1536  oxidoreductase YdhF  79.42 
 
 		 897 bp  276  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1609  oxidoreductase YdhF  79.29 
 
 		 897 bp  268  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1549  oxidoreductase YdhF  79.03 
 
 		 897 bp  252  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2208  aldo/keto reductase  90.57 
 
 		 897 bp  65.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127035  hitchhiker  0.000128272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000475  oxidoreductase aldo/keto reductase 2 family  89.8 
 
 		 909 bp  58  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>