27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2199 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  93.41 
 
 
349 aa  686  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  3.00414e-07  hitchhiker  3.95416e-11 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  95.13 
 
 
349 aa  695  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  90.83 
 
 
348 aa  650  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.97181e-07  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  93.41 
 
 
349 aa  686  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.41733e-05  hitchhiker  2.4539e-09 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  92.26 
 
 
349 aa  672  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1434  hypothetical protein  90.83 
 
 
349 aa  668  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000482166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  722  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  6.39622e-09  hitchhiker  1.28788e-10 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  92.84 
 
 
349 aa  677  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  2.47351e-10 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  91.69 
 
 
349 aa  674  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1767  hypothetical protein  86.25 
 
 
349 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000332816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2076  hypothetical protein  85.39 
 
 
349 aa  628  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2083  protein of unknown function DUF1277  85.39 
 
 
349 aa  628  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000880511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1174  hypothetical protein  81.32 
 
 
351 aa  577  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.55184e-06  hitchhiker  4.02769e-13 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1440  hypothetical protein  80.46 
 
 
351 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1266  hypothetical protein  81.03 
 
 
351 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00314635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2153  hypothetical protein  53.87 
 
 
329 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4451  hypothetical protein  53.87 
 
 
329 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.82249e-06  unclonable  1.57695e-09 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2477  hypothetical protein  51.29 
 
 
331 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0132225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2279  hypothetical protein  51 
 
 
331 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00859838  hitchhiker  4.18085e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2253  hypothetical protein  50.29 
 
 
339 aa  347  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215699  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2614  hypothetical protein  49 
 
 
329 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4112  decreased coverage  0.00553167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01529  predicted protein  82.07 
 
 
192 aa  322  9e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.271996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1003  hypothetical protein  81.44 
 
 
168 aa  283  4e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.787679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01963  hypothetical protein  29.57 
 
 
323 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1000  hypothetical protein  86.84 
 
 
78 aa  134  2e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.13479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0881  hypothetical protein  38.98 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0865  hypothetical protein  38.98 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>