More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2064 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  90.46 
 
 
713 aa  1313    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  90.6 
 
 
713 aa  1318    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  91.82 
 
 
633 aa  1016    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  92.19 
 
 
633 aa  1019    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  96.72 
 
 
702 aa  1388    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  80.37 
 
 
704 aa  1197    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 
702 aa  1465    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  91.45 
 
 
633 aa  1013    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  96.58 
 
 
702 aa  1386    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  90.6 
 
 
713 aa  1317    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  79.8 
 
 
713 aa  1213    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  91.26 
 
 
633 aa  1011    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  44.25 
 
 
741 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  44.4 
 
 
741 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  45.33 
 
 
740 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  45.18 
 
 
740 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  43.84 
 
 
732 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  41.5 
 
 
725 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  42.98 
 
 
617 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  42.81 
 
 
617 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  42.98 
 
 
617 aa  495  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  43.71 
 
 
618 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  44.76 
 
 
609 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  41.68 
 
 
619 aa  480  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  41.33 
 
 
615 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  38.29 
 
 
706 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  42.73 
 
 
616 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  43.86 
 
 
617 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  44.57 
 
 
610 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  39.32 
 
 
678 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  42.83 
 
 
656 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  39.81 
 
 
678 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  42.11 
 
 
655 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  40.65 
 
 
723 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  40.67 
 
 
706 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  36.51 
 
 
682 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  39.75 
 
 
687 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  39.75 
 
 
687 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  39.75 
 
 
687 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  37.6 
 
 
722 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  41.35 
 
 
694 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  35.8 
 
 
692 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  39.86 
 
 
1095 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  38.59 
 
 
722 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  36.36 
 
 
726 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  37.09 
 
 
722 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  38.44 
 
 
655 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  36.11 
 
 
1017 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  39.32 
 
 
694 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  35.12 
 
 
725 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  35.54 
 
 
771 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  35.22 
 
 
725 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  38 
 
 
699 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  33.91 
 
 
709 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  32.13 
 
 
907 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  32.43 
 
 
748 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  30.95 
 
 
741 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  33.68 
 
 
689 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  31.96 
 
 
774 aa  363  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  31.43 
 
 
741 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  32.16 
 
 
730 aa  359  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  33.23 
 
 
689 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  33.39 
 
 
724 aa  352  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  40.28 
 
 
1019 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  34.99 
 
 
697 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  39.36 
 
 
1019 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  39.36 
 
 
842 aa  350  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  31.02 
 
 
741 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  30.76 
 
 
788 aa  343  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  32.19 
 
 
692 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  31.79 
 
 
692 aa  343  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  36.95 
 
 
727 aa  343  9e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  36.27 
 
 
706 aa  342  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  35.56 
 
 
697 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 
734 aa  336  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 
731 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 
734 aa  336  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 
734 aa  336  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 
734 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 
734 aa  336  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 
734 aa  336  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.87 
 
 
712 aa  335  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  32.63 
 
 
754 aa  334  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  29.42 
 
 
731 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  30.64 
 
 
767 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  30.4 
 
 
703 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  32.07 
 
 
754 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  31.17 
 
 
767 aa  330  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  30.14 
 
 
755 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  29.21 
 
 
771 aa  323  8e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  31.3 
 
 
778 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  29.71 
 
 
771 aa  321  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  30.98 
 
 
756 aa  321  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  32.7 
 
 
643 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  30.21 
 
 
785 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  30.79 
 
 
794 aa  317  5e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  34.05 
 
 
680 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  29.04 
 
 
792 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  33.45 
 
 
694 aa  312  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  32.55 
 
 
680 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>