154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2058 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  99.43 
 
 
353 aa  715    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  98.58 
 
 
353 aa  708    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  98.87 
 
 
353 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  99.43 
 
 
353 aa  715    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  99.43 
 
 
353 aa  715    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  98.3 
 
 
353 aa  706    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  99.43 
 
 
353 aa  715    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  99.43 
 
 
353 aa  715    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  89.24 
 
 
353 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  89.8 
 
 
353 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  89.52 
 
 
353 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  89.8 
 
 
353 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  89.8 
 
 
353 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  81.02 
 
 
353 aa  570  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  71.09 
 
 
358 aa  501  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  39.54 
 
 
356 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1057  putative periplasmic protein  39.58 
 
 
361 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00889034  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  38.44 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  34.23 
 
 
381 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  29.94 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0979  hypothetical protein  27.89 
 
 
410 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0114  hypothetical protein  26.17 
 
 
424 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.715385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  26.83 
 
 
458 aa  94  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  26.16 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.32 
 
 
1667 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.1 
 
 
1094 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  25.95 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.19 
 
 
752 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  27.51 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.3 
 
 
601 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.06 
 
 
329 aa  63.2  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  32 
 
 
250 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.67 
 
 
353 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.09 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.18 
 
 
810 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.26 
 
 
819 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.67 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.55 
 
 
354 aa  59.7  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7052  hypothetical protein  26.19 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0830249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  33.65 
 
 
376 aa  59.3  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2566  hypothetical protein  22.36 
 
 
468 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0965859  normal  0.110027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.75 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.28 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.49 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1437  hypothetical protein  26.22 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.31 
 
 
818 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.94 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.62 
 
 
829 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.97 
 
 
154 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1184  hypothetical protein  27.84 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.362079 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1104  hypothetical protein  27.84 
 
 
324 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.22 
 
 
366 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.49 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3159  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0577  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.28 
 
 
652 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.36 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.22 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.29 
 
 
383 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.35 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0079  hypothetical protein  25.41 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.74 
 
 
660 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  26.5 
 
 
387 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  25.41 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.6 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.91 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  22.03 
 
 
479 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  24.39 
 
 
314 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2457  cytochrome d1 heme region  25.39 
 
 
660 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.35 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.34 
 
 
479 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  24.79 
 
 
971 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.41 
 
 
366 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.07 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.86 
 
 
311 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3472  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.37 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2626  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.73 
 
 
659 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  23.74 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.83 
 
 
689 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.07 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.47 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.15 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.28 
 
 
974 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.8 
 
 
333 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
776 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.29 
 
 
348 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  25.11 
 
 
332 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.94 
 
 
457 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.13 
 
 
335 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.46 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.77 
 
 
336 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1946  lipoprotein, putative  24.67 
 
 
945 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2303  hypothetical protein  24.67 
 
 
945 aa  49.3  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.95 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0188  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.43 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.37 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.85 
 
 
1067 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3149  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.79 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>