12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2037 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2037    100 
 
 		 279 bp  553  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000133516  unclonable  6.07771e-25 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1743  benzoate membrane transport protein  99.28 
 
 		 279 bp  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000316549  unclonable  7.90007e-22 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01391  predicted benzoate transporter  98.92 
 
 		 1176 bp  527  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2213  benzoate transporter  98.92 
 
 		 1176 bp  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.8089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2226  benzoate transporter  98.92 
 
 		 1176 bp  527  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.711061 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01401  hypothetical protein  98.92 
 
 		 1176 bp  527  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1518  benzoate transporter  98.56 
 
 		 1269 bp  519  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1612  benzoate transporter  98.18 
 
 		 1269 bp  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.795088  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1720  benzoate transporter  82.11 
 
 		 1179 bp  54  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1784    85.71 
 
 		 1179 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1723  benzoate transporter  85.71 
 
 		 1179 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.26811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1555  benzoate transporter  85.71 
 
 		 1179 bp  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>