278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1707 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  100 
 
 
463 aa  920    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  75.77 
 
 
462 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  75.77 
 
 
462 aa  658    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  100 
 
 
463 aa  920    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  94.17 
 
 
465 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  75.77 
 
 
462 aa  658    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  75.66 
 
 
466 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  100 
 
 
463 aa  920    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  100 
 
 
463 aa  920    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  99.78 
 
 
463 aa  919    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  72.77 
 
 
468 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  93.95 
 
 
465 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  74.35 
 
 
463 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  75.44 
 
 
466 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  73.87 
 
 
463 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  75.44 
 
 
466 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  100 
 
 
461 aa  914    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  75.44 
 
 
466 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  94.38 
 
 
465 aa  849    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  100 
 
 
463 aa  920    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  94.38 
 
 
465 aa  849    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  70.13 
 
 
472 aa  638    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  70.13 
 
 
472 aa  638    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  93.95 
 
 
465 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  100 
 
 
463 aa  920    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  75.77 
 
 
462 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  75.99 
 
 
462 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  100 
 
 
463 aa  920    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  75.55 
 
 
462 aa  656    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  79 
 
 
462 aa  702    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  75.55 
 
 
462 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  75.44 
 
 
462 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  85.96 
 
 
465 aa  792    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  75.77 
 
 
462 aa  657    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  70.84 
 
 
462 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  70.63 
 
 
462 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  59.44 
 
 
468 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  59.66 
 
 
468 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  57.08 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  55.09 
 
 
460 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  55.82 
 
 
461 aa  495  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  54.42 
 
 
459 aa  491  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  52.42 
 
 
475 aa  489  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  53.7 
 
 
905 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  55.29 
 
 
460 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  52.43 
 
 
912 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  53.61 
 
 
477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  52.48 
 
 
893 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  53.52 
 
 
469 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  52.84 
 
 
895 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  53.95 
 
 
461 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  53.65 
 
 
490 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  53.65 
 
 
490 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  53.95 
 
 
461 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  54.17 
 
 
461 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  53.95 
 
 
461 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  53.95 
 
 
461 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  53.43 
 
 
490 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  49.89 
 
 
475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  53.91 
 
 
461 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  55.82 
 
 
457 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  53.22 
 
 
457 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  53.91 
 
 
461 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  50 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  52.63 
 
 
461 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  49.45 
 
 
475 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  52.9 
 
 
487 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  53.04 
 
 
486 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  51.93 
 
 
481 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  50.73 
 
 
481 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  50.75 
 
 
917 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  44.87 
 
 
458 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  43.09 
 
 
502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  49.34 
 
 
699 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2725  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 
457 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 
476 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1268  major facilitator transporter  40.17 
 
 
470 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  44.17 
 
 
440 aa  316  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0123959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  41.05 
 
 
463 aa  315  8e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0502374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  42.17 
 
 
455 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  41.99 
 
 
456 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
475 aa  309  6.999999999999999e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 
458 aa  309  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3492  nitrite transporter  41.23 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2417  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 
467 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000388918  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0837  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738269  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
469 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1822  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 
440 aa  280  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.679534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2636  nitrate/nitrite antiporter  34.93 
 
 
551 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2166  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 
461 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.0459407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 
453 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2247  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 
469 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00033016  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12352  nitrite extrusion protein 1 narK1 (nitrite facilitator 1)  35.04 
 
 
515 aa  262  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2593  major facilitator transporter  35.18 
 
 
455 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.593061  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3044  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
461 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0440547  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0254  major facilitator transporter  36.21 
 
 
464 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.78177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0264  major facilitator transporter  36.21 
 
 
464 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0274  major facilitator transporter  36.21 
 
 
464 aa  257  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
438 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>