110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1690 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01184  outer membrane lipoprotein LolB precursor  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2417  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1690  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.07213e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01194  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.148307  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1357  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  9.90201e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1314  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10519e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2438  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 
207 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1933  outer membrane lipoprotein LolB  99.52 
 
 
207 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  6.07555e-10  normal  0.239463 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1373  outer membrane lipoprotein LolB  99.03 
 
 
207 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.52349e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1544  outer membrane lipoprotein LolB  91.79 
 
 
207 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0381388  normal  0.080998 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1910  outer membrane lipoprotein LolB  91.79 
 
 
207 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.728098 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1360  outer membrane lipoprotein LolB  91.79 
 
 
207 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  5.30906e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1916  outer membrane lipoprotein LolB  91.3 
 
 
207 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00275751  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1974  outer membrane lipoprotein LolB  91.79 
 
 
207 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356364  normal  0.962813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2339  outer membrane lipoprotein LolB  85.07 
 
 
203 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1988  outer membrane lipoprotein LolB  63.77 
 
 
207 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.253229  hitchhiker  0.00995537 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2462  outer membrane lipoprotein LolB  63.77 
 
 
207 aa  267  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00307032  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1854  outer membrane lipoprotein LolB  59.9 
 
 
206 aa  264  6e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2068  outer membrane lipoprotein LolB  63.29 
 
 
207 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.33771e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2181  outer membrane lipoprotein LolB  62.8 
 
 
207 aa  261  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.865932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2116  outer membrane lipoprotein LolB  62.32 
 
 
207 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2409  outer membrane lipoprotein LolB  61.35 
 
 
207 aa  254  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2070  outer membrane lipoprotein LolB  57.97 
 
 
206 aa  253  2e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00533994  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0291  outer membrane lipoprotein LolB  35.38 
 
 
215 aa  157  1e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0998  outer membrane lipoprotein LolB  29.35 
 
 
209 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0788  outer membrane lipoprotein LolB  30.24 
 
 
203 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0229958  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0913  outer membrane lipoprotein LolB  28.65 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.470725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1758  outer membrane lipoprotein LolB  32.77 
 
 
211 aa  94  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.19306e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0525  outer membrane lipoprotein LolB  28.95 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01248  outer membrane lipoprotein LolB  28.65 
 
 
212 aa  84.3  1e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2028  outer membrane lipoprotein LolB  26.87 
 
 
210 aa  81.3  8e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0058  outer membrane lipoprotein LolB  26.87 
 
 
210 aa  81.3  8e-15  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.945413  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0991  outer membrane lipoprotein LolB  23.96 
 
 
203 aa  78.2  7e-14  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.389925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004205  outer membrane lipoprotein LolB precursor  26.4 
 
 
203 aa  78.2  8e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.60033e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0946  outer membrane lipoprotein LolB  28.22 
 
 
205 aa  77.8  1e-13  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.562833  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2363  outer membrane lipoprotein LolB  28.02 
 
 
208 aa  75.9  4e-13  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0512  outer membrane lipoprotein LolB  26.63 
 
 
201 aa  75.9  4e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1106  outer membrane lipoprotein LolB  27.72 
 
 
205 aa  75.9  4e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1166  outer membrane lipoprotein LolB  27.93 
 
 
221 aa  75.9  5e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.965253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1057  outer membrane lipoprotein LolB  27.23 
 
 
204 aa  75.5  6e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0342955  normal  0.469069 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41500  outer membrane lipoprotein LolB  27.18 
 
 
208 aa  73.9  1e-12  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263625  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0343  outer membrane lipoprotein LolB  24.87 
 
 
216 aa  72  5e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.447592 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3625  outer membrane lipoprotein LolB  27.67 
 
 
200 aa  70.5  1e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0608  hypothetical protein  26.24 
 
 
199 aa  71.2  1e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0589  hypothetical protein  26.24 
 
 
199 aa  70.9  1e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0768  outer membrane lipoprotein LolB  28.35 
 
 
205 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4459  outer membrane lipoprotein LolB  28.35 
 
 
205 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0680  outer membrane lipoprotein LolB  27.23 
 
 
200 aa  70.1  2e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0724  outer membrane lipoprotein LolB  28.35 
 
 
205 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0758  outer membrane lipoprotein LolB  30.06 
 
 
205 aa  68.6  6e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0281  outer membrane lipoprotein LolB  26.8 
 
 
200 aa  66.6  2e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3128  outer membrane lipoprotein LolB  26.94 
 
 
219 aa  66.6  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.39408e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4751  outer membrane lipoprotein LolB  27.09 
 
 
205 aa  65.5  5e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.208461  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1526  outer membrane lipoprotein LolB  24.59 
 
 
214 aa  64.7  8e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191238  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0918  outer membrane lipoprotein LolB  25.39 
 
 
203 aa  62.8  3e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.126701  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2568  outer membrane lipoprotein LolB  28 
 
 
207 aa  62.4  4e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00716093  normal  0.193169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5317  outer membrane lipoprotein LolB  24.73 
 
 
205 aa  60.8  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0694  outer membrane lipoprotein LolB  27.5 
 
 
214 aa  61.2  1e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3616  outer membrane lipoprotein LolB  27.5 
 
 
214 aa  60.8  1e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0409991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61740  outer membrane lipoprotein LolB  24.19 
 
 
205 aa  60.5  2e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3555  putative outer membrane lipoprotein LolB  23.56 
 
 
215 aa  60.5  2e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.460457  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0587  outer membrane lipoprotein LolB  28.68 
 
 
247 aa  60.1  2e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3548  outer membrane lipoprotein LolB  27.5 
 
 
214 aa  60.5  2e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.434882  hitchhiker  3.61379e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3739  outer membrane lipoprotein LolB  27 
 
 
214 aa  59.3  4e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.137488  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0317  outer membrane lipoprotein LolB  28.23 
 
 
210 aa  57.8  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182895  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2565  outer membrane lipoprotein LolB  22.42 
 
 
218 aa  56.2  4e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3461  outer membrane lipoprotein LolB  25.39 
 
 
218 aa  56.2  4e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0667609  normal  0.949201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4131  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 
211 aa  55.5  5e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184636  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3728  Outer membrane lipoprotein LolB  26.11 
 
 
190 aa  55.8  5e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1054  outer membrane lipoprotein LolB, putative  25.63 
 
 
202 aa  54.3  1e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.478428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04545  outer membrane lipoprotein LolB  27.06 
 
 
217 aa  54.7  1e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.866316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2383  outer membrane lipoprotein LolB  27.92 
 
 
218 aa  53.9  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.571518 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2763  outer membrane lipoprotein LolB, putative  27.92 
 
 
218 aa  53.9  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3254  GntR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
209 aa  53.5  2e-06  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.216885  normal  0.0301472 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0515  outer membrane lipoprotein LolB  34.81 
 
 
206 aa  53.9  2e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00665146  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3687  outer membrane lipoprotein LolB  28.35 
 
 
213 aa  53.1  3e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0163127  normal  0.471305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0587  outer membrane lipoprotein LolB  30.19 
 
 
210 aa  52.8  4e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178798  hitchhiker  0.00290914 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2914  outer membrane lipoprotein LolB  28.05 
 
 
216 aa  50.4  2e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  3.24286e-06  normal  0.441694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0767  outer membrane lipoprotein LolB  29.49 
 
 
214 aa  50.4  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000782252  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3171  outer membrane lipoprotein LolB  28.85 
 
 
214 aa  49.7  3e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00520564  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3602  outer membrane lipoprotein LolB  21.08 
 
 
192 aa  49.3  4e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0266005  normal  0.277706 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0795  outer membrane lipoprotein LolB  27.1 
 
 
214 aa  48.9  5e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000501463  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2120  outer membrane lipoprotein LolB  26.28 
 
 
218 aa  48.5  7e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  2.99e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2209  outer membrane lipoprotein LolB  25.9 
 
 
216 aa  48.5  8e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00128485  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2103  outer membrane lipoprotein LolB  27.34 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0502243  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0397  outer membrane lipoprotein LolB  26.22 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  1.78523e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6130  outer membrane lipoprotein LolB  31.85 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.31335e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2718  outer membrane lipoprotein LolB  33.66 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  8.27751e-05  normal  0.448755 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2860  outer membrane lipoprotein LolB  33.66 
 
 
206 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00718915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0477  outer membrane lipoprotein LolB  32.32 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2811  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2186  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2800  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0768098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0799  outer membrane lipoprotein LolB  26.28 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000308164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3835  outer membrane lipoprotein LolB  26.45 
 
 
214 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3117  outer membrane lipoprotein LolB  32.61 
 
 
215 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.632142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0756  outer membrane lipoprotein LolB  32.61 
 
 
207 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0085  outer membrane lipoprotein LolB  32.61 
 
 
211 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0572  outer membrane lipoprotein LolB  32.61 
 
 
207 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1505  outer membrane lipoprotein LolB  32.61 
 
 
219 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0117996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>