23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1467 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  99.4 
 
 
522 bp  963  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.18944e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  99 
 
 
522 bp  948  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  92.63 
 
 
522 bp  694  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  2.30682e-13 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  92.63 
 
 
522 bp  694  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  5.2483e-10 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  92.43 
 
 
522 bp  686  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.96903e-06  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  92.63 
 
 
522 bp  694  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  8.50849e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  92.63 
 
 
522 bp  694  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.45299e-05  hitchhiker  1.56783e-12 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1467    100 
 
 
501 bp  993  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.66812e-09  hitchhiker  1.80859e-11 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  99.4 
 
 
522 bp  963  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.03492e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  99.6 
 
 
522 bp  971  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.23338e-10  hitchhiker  3.03245e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  99.2 
 
 
522 bp  955  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.85112e-09  hitchhiker  6.61717e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2559  protein of unknown function DUF177  99.2 
 
 
522 bp  955  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.87302e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  99.4 
 
 
522 bp  963  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.84281e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  99.2 
 
 
522 bp  955  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1603  hypothetical protein  91.04 
 
 
522 bp  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.20656e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  83.67 
 
 
522 bp  127  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.46224e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3504  hypothetical protein  83.72 
 
 
525 bp  119  8e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.22055e-08  hitchhiker  0.00648337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1681  hypothetical protein  83.72 
 
 
525 bp  119  8e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.42559e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  83.16 
 
 
522 bp  119  8e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.57627e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1573  hypothetical protein  83.72 
 
 
525 bp  119  8e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.25555e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  83.66 
 
 
522 bp  97.6  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  8.44005e-11  hitchhiker  6.03572e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1582  hypothetical protein  81.61 
 
 
522 bp  91.7  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000319504  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  96.3 
 
 
522 bp  91.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  8.31476e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>