263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1461 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  99.27 
 
 
547 aa  1084    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  99.09 
 
 
547 aa  1083    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 
553 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  99.27 
 
 
547 aa  1084    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 
553 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 
553 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  99.82 
 
 
547 aa  1091    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 
553 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  99.45 
 
 
547 aa  1086    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
547 aa  1092    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  98.54 
 
 
547 aa  1079    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  99.82 
 
 
547 aa  1091    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  98.72 
 
 
547 aa  1079    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  72.58 
 
 
546 aa  816    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  79.42 
 
 
553 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  58.08 
 
 
554 aa  618  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  58.08 
 
 
554 aa  618  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  57.89 
 
 
554 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  55.56 
 
 
548 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  53.95 
 
 
568 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1877  flagellar hook-associated protein FlgK  54.5 
 
 
556 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  49.81 
 
 
551 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  43.96 
 
 
539 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  42.99 
 
 
541 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  51.69 
 
 
640 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  40.66 
 
 
631 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  43.05 
 
 
631 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  42.05 
 
 
652 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  36.07 
 
 
645 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  34.11 
 
 
549 aa  266  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  37.76 
 
 
683 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  36.04 
 
 
657 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  36.71 
 
 
667 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 
667 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 
667 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 
667 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 
714 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 
667 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 
667 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
637 aa  248  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  35.65 
 
 
667 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  34.17 
 
 
647 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  35.45 
 
 
657 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  33.64 
 
 
657 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  35.96 
 
 
629 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.75 
 
 
682 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
676 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  36.16 
 
 
638 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  31.07 
 
 
683 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  34.94 
 
 
642 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  32.14 
 
 
682 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  35.38 
 
 
645 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  35.38 
 
 
645 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  34.54 
 
 
659 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  35.09 
 
 
641 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  36.3 
 
 
660 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  35.53 
 
 
665 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
681 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  35.06 
 
 
665 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  31.77 
 
 
920 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  33.86 
 
 
686 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  33.41 
 
 
643 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  33.41 
 
 
643 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  33.41 
 
 
643 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  32.96 
 
 
624 aa  207  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  32.96 
 
 
624 aa  207  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  32.21 
 
 
686 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
640 aa  206  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.29 
 
 
680 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  33.64 
 
 
626 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  31.26 
 
 
644 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.94 
 
 
680 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  33.41 
 
 
653 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  29.96 
 
 
688 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
685 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  32.18 
 
 
640 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 
681 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 
649 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  30.21 
 
 
649 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  29.95 
 
 
672 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  30.07 
 
 
691 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  31.31 
 
 
642 aa  177  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
660 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  26.58 
 
 
630 aa  176  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 
638 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  28.14 
 
 
583 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 
695 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 
638 aa  162  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 
658 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 
637 aa  160  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
624 aa  160  8e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  28.95 
 
 
709 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  28.43 
 
 
680 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  28.67 
 
 
642 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 
477 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
641 aa  157  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 
641 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  29.26 
 
 
641 aa  157  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
641 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
560 aa  156  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>