More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1357 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  56.27 
 
 
698 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  90.23 
 
 
695 aa  1303    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  56.27 
 
 
698 aa  788    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  100 
 
 
696 aa  1426    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  58.61 
 
 
714 aa  823    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  53.12 
 
 
702 aa  751    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  99.86 
 
 
696 aa  1425    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  56.27 
 
 
698 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  46.05 
 
 
743 aa  599  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  41.8 
 
 
726 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  36.48 
 
 
806 aa  452  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  35.98 
 
 
696 aa  422  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  35.63 
 
 
702 aa  412  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  35.47 
 
 
698 aa  404  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 
804 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  33.93 
 
 
696 aa  393  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  35.06 
 
 
653 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.68 
 
 
655 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  35.36 
 
 
652 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.76 
 
 
665 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  35.21 
 
 
665 aa  364  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  35.21 
 
 
665 aa  364  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  35.21 
 
 
665 aa  364  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 
652 aa  360  6e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  32.91 
 
 
666 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  32.92 
 
 
666 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  33.01 
 
 
666 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  32.92 
 
 
666 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  32.92 
 
 
666 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 
740 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  32.22 
 
 
663 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.71 
 
 
700 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 
658 aa  339  8e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  31.56 
 
 
663 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.07 
 
 
656 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  34.65 
 
 
698 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 
713 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.44 
 
 
704 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  31.8 
 
 
680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  30.99 
 
 
697 aa  308  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  33.53 
 
 
656 aa  307  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  32.63 
 
 
676 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  33.81 
 
 
572 aa  296  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 
799 aa  293  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 
799 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.15 
 
 
650 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.15 
 
 
650 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.15 
 
 
650 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.15 
 
 
650 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.01 
 
 
650 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  32.48 
 
 
659 aa  287  4e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 
799 aa  287  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  32.31 
 
 
641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  32.15 
 
 
663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 
663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  32.15 
 
 
663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  32.15 
 
 
663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  32.01 
 
 
663 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  32.01 
 
 
663 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 
739 aa  280  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 
715 aa  276  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  32.15 
 
 
732 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  29.57 
 
 
656 aa  273  6e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 
681 aa  268  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  31.2 
 
 
635 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.05 
 
 
653 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 
648 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 
680 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 
653 aa  258  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 
662 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 
662 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 
649 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 
649 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 
662 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 
649 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 
661 aa  250  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
657 aa  248  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 
665 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.58 
 
 
640 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  30.2 
 
 
759 aa  212  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  29.08 
 
 
746 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  30.17 
 
 
744 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.51 
 
 
746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  29.48 
 
 
744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.38 
 
 
746 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  28.25 
 
 
746 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  28.25 
 
 
746 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.5 
 
 
744 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28.38 
 
 
746 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  28.25 
 
 
746 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  28.38 
 
 
746 aa  197  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  28.25 
 
 
746 aa  197  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 
650 aa  197  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  28.12 
 
 
746 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  27.52 
 
 
750 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.74 
 
 
742 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  27.15 
 
 
740 aa  187  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  28.02 
 
 
742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  27.82 
 
 
757 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  26.93 
 
 
703 aa  185  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>