More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1330 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1330  50S ribosomal protein L31 type B  100 
 
 
87 aa  178  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0350  50S ribosomal protein L31 type B  94.25 
 
 
87 aa  169  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.380768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00255  50S ribosomal protein L31  93.1 
 
 
87 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3308  ribosomal protein L31  93.1 
 
 
88 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010761  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0342  50S ribosomal protein L31 type B  93.1 
 
 
87 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146982  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3323  50S ribosomal protein L31 type B  93.1 
 
 
88 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00259  hypothetical protein  93.1 
 
 
87 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0307  50S ribosomal protein L31 type B  93.1 
 
 
88 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0324  50S ribosomal protein L31 type B  93.1 
 
 
87 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000277542  normal  0.105012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0934  50S ribosomal protein L31 type B  72.09 
 
 
86 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.626009  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0529  50S ribosomal protein L31 type B  73.26 
 
 
86 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0519  50S ribosomal protein L31 type B  73.26 
 
 
86 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000807514  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0510  50S ribosomal protein L31 type B  73.26 
 
 
86 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000510204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0572  50S ribosomal protein L31 type B  73.26 
 
 
86 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000109975  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0513  50S ribosomal protein L31 type B  73.26 
 
 
86 aa  134  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000862456  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3210  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000321359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3069  50S ribosomal protein L31 type B  69.05 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.10259e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1068  50S ribosomal protein L31 type B  71.25 
 
 
82 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.788899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03250  50S ribosomal protein L31 type B  68.24 
 
 
86 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1125  50S ribosomal protein L31 type B  64.71 
 
 
85 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000113817  unclonable  0.00000000942965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3243  50S ribosomal protein L31 type B  71.25 
 
 
82 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0402  50S ribosomal protein L31 type B  64.71 
 
 
85 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000944485  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002727  LSU ribosomal protein L31p  66.28 
 
 
86 aa  120  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0694209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3049  ribosomal protein L31  66.27 
 
 
83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0096084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3920  50S ribosomal protein L31 type B  59.3 
 
 
93 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348577  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4183  ribosomal protein L31  60.49 
 
 
93 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17700  50S ribosomal protein L31 type B  63.53 
 
 
87 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111738  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0890  50S ribosomal protein L31 type B  60.76 
 
 
85 aa  107  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1540  50S ribosomal protein L31 type B  61.18 
 
 
87 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.267597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1916  50S ribosomal protein L31 type B  49.43 
 
 
93 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000248892  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0507  50S ribosomal protein L31 type B  52.5 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869204  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2207  50S ribosomal protein L31 type B  51.25 
 
 
93 aa  90.5  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0240279  normal  0.0216072 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2250  50S ribosomal protein L31 type B  59.49 
 
 
87 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3289  ribosomal protein L31  48.75 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.399256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2137  50S ribosomal protein L31P  50.59 
 
 
86 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171095  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6358  ribosomal protein L31  53.85 
 
 
90 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1117  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0238519  normal  0.245393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1025  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.010082  normal  0.336183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2751  50S ribosomal protein L31 type B  51.9 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.178212  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1440  50S ribosomal protein L31 type B  48.81 
 
 
87 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219049  normal  0.0157009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2291  50S ribosomal protein L31P  51.9 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000143826  normal  0.236339 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0263  50S ribosomal protein L31 type B  43.59 
 
 
83 aa  81.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2213  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2857  50S ribosomal protein L31 type B  48.75 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.329217 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1857  50S ribosomal protein L31 type B  47.62 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316845  normal  0.0801388 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6246  50S ribosomal protein L31 type B  47.62 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1833  50S ribosomal protein L31 type B  47.62 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.012708  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0592  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
85 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0536  50S ribosomal protein L31 type B  46.15 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000345186  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1744  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.372125  normal  0.163182 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0947  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589085  normal  0.576162 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2120  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125341  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5134  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 
86 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.593671  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1771  50S ribosomal protein L31 type B  51.28 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7574  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1703  50S ribosomal protein L31 type B  46.25 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000392946  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0787  50S ribosomal protein L31 type B  44.87 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0637  50S ribosomal protein L31 type B  46.59 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1784  50S ribosomal protein L31P  46.15 
 
 
80 aa  78.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000581965  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2127  50S ribosomal protein L31 type B  48.15 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.029329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1878  50S ribosomal protein L31 type B  48.15 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793429 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2194  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0620281  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2367  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  normal  0.172582 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2156  50S ribosomal protein L31 type B  46.84 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.475244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1820  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0400323 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1309  50S ribosomal protein L31 type B  46.59 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1727  50S ribosomal protein L31 type B  48.1 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000829629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1182  50S ribosomal protein L31 type B  49.37 
 
 
87 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000836731  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11228  50S ribosomal protein L31  43.21 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1539  50S ribosomal protein L31 type B  43.21 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1369  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00759194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2380  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2253  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.081991  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0125  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000012592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2215  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1131  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.297001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1860  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0037  50S ribosomal protein L31 type B  48.72 
 
 
87 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0133006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1557  ribosomal protein L31  48.75 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0965465  decreased coverage  0.00916576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0489  50S ribosomal protein L31P  50 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0923  ribosomal protein L31  46.15 
 
 
85 aa  77  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.587387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1654  50S ribosomal protein L31P  54.93 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0786  50S ribosomal protein L31 type B  46.25 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5454  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5180  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00675998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5015  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.65969e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5031  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000768356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5423  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.27581e-63 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0873  50S ribosomal protein L31 type B  46.25 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00543783  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3852  50S ribosomal protein L31 type B  45.57 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000664047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5574  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588465  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0526  ribosomal protein L31  48.05 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3254  50S ribosomal protein L31 type B  45 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5509  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5458  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0109  50S ribosomal protein L31 type B  45 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22097  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5498  50S ribosomal protein L31 type B  44.3 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000131175  unclonable  2.48072e-26 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3270  ribosomal protein L31  51.25 
 
 
80 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0450  50S ribosomal protein L31 type B  40 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000490006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4370  ribosomal protein L31  46.25 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.0154955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>