More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1268 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  100 
 
 
504 aa  1041    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  39.23 
 
 
516 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  39.23 
 
 
516 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.02 
 
 
516 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  39.02 
 
 
516 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  39.02 
 
 
516 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  37.24 
 
 
535 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  37.27 
 
 
534 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2339  aminoglycoside response regulator  29.68 
 
 
526 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000320511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02106  hypothetical protein  31.51 
 
 
518 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1481  diguanylate phosphodiesterase  31.51 
 
 
518 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02065  hypothetical protein  31.51 
 
 
518 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2314  hypothetical protein  31.51 
 
 
518 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1471  hypothetical protein  31.51 
 
 
518 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000861353  normal  0.0219942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2474  hypothetical protein  31.37 
 
 
518 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505117  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2566  hypothetical protein  31.07 
 
 
518 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2452  hypothetical protein  31.07 
 
 
518 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000990794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2364  hypothetical protein  30.87 
 
 
518 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406164  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0782  hypothetical protein  31.18 
 
 
518 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3314  hypothetical protein  32.15 
 
 
497 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0795943  normal  0.253919 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2455  hypothetical protein  30.87 
 
 
518 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2409  hypothetical protein  30.87 
 
 
518 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.948391  hitchhiker  0.000104823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2325  hypothetical protein  31.13 
 
 
518 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.802767  hitchhiker  0.00255877 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3245  hypothetical protein  32.56 
 
 
528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0153368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2772  hypothetical protein  32.32 
 
 
518 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1089  diguanylate phosphodiesterase  29.61 
 
 
512 aa  213  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.725575  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2384  diguanylate phosphodiesterase  32.59 
 
 
532 aa  213  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3729  diguanylate phosphodiesterase  31.18 
 
 
506 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3538  diguanylate phosphodiesterase  30.9 
 
 
506 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.506628  decreased coverage  0.0000122226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3606  diguanylate phosphodiesterase  31.02 
 
 
506 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0705  diguanylate phosphodiesterase  31.13 
 
 
506 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3821  rtn protein  29.59 
 
 
515 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0814  EAL domain-containing protein  29.71 
 
 
514 aa  207  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0777  EAL domain-containing protein  41.22 
 
 
519 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2028  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  30.68 
 
 
533 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05545  sensory transduction protein kinase  29.64 
 
 
506 aa  201  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1971  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.49 
 
 
533 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1967  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  30.49 
 
 
533 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.352201  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1489  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  42.47 
 
 
460 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1304  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  42.47 
 
 
474 aa  197  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0784457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1264  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  36.2 
 
 
521 aa  194  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0322571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2458  diguanylate phosphodiesterase  35.84 
 
 
521 aa  192  9e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01143  conserved inner membrane protein  35.84 
 
 
507 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2920  diguanylate phosphodiesterase  27.92 
 
 
511 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1307  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  36.2 
 
 
521 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.654083  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01151  hypothetical protein  35.84 
 
 
507 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2480  diguanylate phosphodiesterase  35.84 
 
 
521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0186873  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2785  hypothetical protein  34.09 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2710  hypothetical protein  34.09 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  34.62 
 
 
525 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  27.03 
 
 
500 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14530  hypothetical protein  27.49 
 
 
523 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2811  EAL domain-containing protein  27.61 
 
 
538 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1983  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  35.84 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.123377  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1373  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  38.87 
 
 
532 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.295034  normal  0.0183228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01785  predicted phosphodiesterase  38.87 
 
 
532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1828  diguanylate phosphodiesterase  38.87 
 
 
532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.566972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1905  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  38.87 
 
 
532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.184783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2544  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  38.87 
 
 
532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0252853  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1818  diguanylate phosphodiesterase  38.87 
 
 
532 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0704068  normal  0.546752 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  39.36 
 
 
685 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1286  hypothetical protein  28.13 
 
 
521 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  36.18 
 
 
374 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  27.88 
 
 
501 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3435  diguanylate phosphodiesterase  26.71 
 
 
528 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  28.63 
 
 
530 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  37.5 
 
 
532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4145  hypothetical protein  35.82 
 
 
500 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  34.48 
 
 
528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0661  signal transduction protein  35.66 
 
 
1006 aa  174  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5008  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 
534 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5852  diguanylate phosphodiesterase  26.13 
 
 
534 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1559  hypothetical protein  38.26 
 
 
532 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  34.35 
 
 
538 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4327  diguanylate phosphodiesterase  24.17 
 
 
534 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0532926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.86 
 
 
533 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.86 
 
 
533 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.86 
 
 
516 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.54 
 
 
533 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3236  diguanylate phosphodiesterase  26.65 
 
 
546 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05448  hypothetical protein  37.02 
 
 
489 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.86 
 
 
533 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001510  Rtn protein  26.4 
 
 
490 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1798  diguanylate phosphodiesterase  26.23 
 
 
520 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199517  normal  0.66089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2438  diguanylate phosphodiesterase  26.89 
 
 
528 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2398  periplasmic sensor diguanylate phophodiesterase  29.18 
 
 
506 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.625554  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.64 
 
 
516 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.74 
 
 
516 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2328  diguanylate phosphodiesterase  26.48 
 
 
528 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3385  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.34 
 
 
677 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.093446  hitchhiker  0.00322897 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.86 
 
 
762 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0821  EAL domain-containing protein  37.32 
 
 
541 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  34.72 
 
 
1093 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.93 
 
 
516 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  32.93 
 
 
516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  38.22 
 
 
537 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1152  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.46 
 
 
1120 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8060  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain-like protein  35.34 
 
 
870 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003646  Rtn protein  35.81 
 
 
498 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5086  diguanylate phosphodiesterase  26.4 
 
 
546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>