More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0846 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0846  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  7.74084e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.07183e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.01635e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0814  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000653999  normal  0.868526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.62037e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0850  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  2.32917e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0817  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  8.62266e-05  normal  0.885127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0849  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  2.40057e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0847  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  3.90695e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0818  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0005423  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0790  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.13232e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0851  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.56782e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0881  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.14507e-05  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0878  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.33144e-05  normal  0.655098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4655  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  8.59319e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0787  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.14753e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0910  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.10195e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0913  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000921732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.08772e-05  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0882  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.05642e-05  normal  0.563094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.00232e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2783  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.45376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0816  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  9.28863e-05  normal  0.881933 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0880  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  1.31793e-05  normal  0.645347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  2.25732e-09  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0819  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  normal  0.860753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2611  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  6.69523e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.73976e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.29653e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  7.9938e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.36823e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.95184e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4657  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.39689e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  1.84687e-09  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.75421e-08  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  3.51036e-08  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0064  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  6.62129e-07  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.98459e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.92703e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.75235e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.39048e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  9.59618e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  6.23521e-08  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.77417e-08  normal  0.268649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0069  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  6.22929e-07  normal  0.276829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.04848e-05  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0036  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  5.84737e-09  hitchhiker  0.00132337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  7.15976e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.71362e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2677  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000682984  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0912  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000796391  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3637  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.42808e-08  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  1.48305e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.53086e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.77997e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0056  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.93092e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.88503e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna031  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00444956  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna013  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.25006e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna057  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna026  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0677758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00015  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  1.91141e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.15429e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2562  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.96401e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2653  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  1.00151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0791  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.23081e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0914  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00299475  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0850  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.47558e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2783  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  6.64691e-05  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00020  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  8.93076e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  9.23528e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.50882e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0848  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.63813e-06  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  1.92994e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4226  tRNA-Lys  98.7 
 
 
78 bp  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.08643e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1400  tRNA-Lys  98.7 
 
 
78 bp  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524928  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4253  tRNA-Lys  98.7 
 
 
78 bp  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.87819e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00251  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06830  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00376  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2736  tRNA-Lys  98.7 
 
 
78 bp  145  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000214586  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00467  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1118t  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0096156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3189t  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0401929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3087t  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00291749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3081t  tRNA-Lys  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000675432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0018  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  6.46357e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4252  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.73353e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4251  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.89937e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4250  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.79224e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0593  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0789  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  9.38184e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0032  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0055  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.444968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0037  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.813487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0060  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  4.24402e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0061  tRNA-Lys  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  4.33074e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>