17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0317 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0317  protein ash  100 
 
 
110 aa  224  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.387224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0047  putative bacteriophage protein  65.14 
 
 
196 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1057  putative bacteriophage protein  65.14 
 
 
196 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4007  phage protein  65.14 
 
 
134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  62.96 
 
 
183 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  51.35 
 
 
131 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000108991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2961  phage immunity repressor protein  72.13 
 
 
64 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  hitchhiker  0.00000287502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4844  phage immunity repressor protein  64.52 
 
 
63 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369525 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  52.46 
 
 
380 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  33.88 
 
 
284 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4078  hypothetical protein  37.74 
 
 
262 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3698  prophage protein  61.7 
 
 
178 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0871158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  47.37 
 
 
282 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0377  phage immunity repressor protein  50 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114796  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4779  phage immunity repressor protein  50 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3549  prophage protein  54.35 
 
 
179 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3708  prophage protein  54.35 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>