174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0293 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  100 
 
 
237 aa  489  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  70.28 
 
 
231 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  54.62 
 
 
240 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  47.68 
 
 
240 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  47.68 
 
 
240 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  47.68 
 
 
240 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  35.78 
 
 
234 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  39.9 
 
 
215 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  34.93 
 
 
218 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  37.04 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  32.57 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  32.57 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  32.42 
 
 
221 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  37.56 
 
 
229 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  36.18 
 
 
217 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  31.8 
 
 
229 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  46.88 
 
 
216 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  33.98 
 
 
216 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  33.98 
 
 
216 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  36 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  35.02 
 
 
232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  46.51 
 
 
133 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  33.49 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  31.36 
 
 
230 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  45.38 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  33.02 
 
 
217 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  31.92 
 
 
216 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 
217 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  43.08 
 
 
243 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  32.27 
 
 
222 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  32.71 
 
 
228 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  31.53 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  28.93 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.66 
 
 
207 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  29.41 
 
 
224 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  37.88 
 
 
215 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  32.37 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 
209 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  27.56 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  30.41 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  31.85 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  29.67 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  36.94 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  30.21 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.41 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.03 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  31.5 
 
 
201 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.5 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  33.79 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  28.29 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.82 
 
 
149 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.692907 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  34.53 
 
 
224 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  23.91 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2558  LexA repressor  35.54 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal  0.0134465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  24.38 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1563  repressor protein CI homolog  36.84 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  30.86 
 
 
209 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.58 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0668  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.07 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.396258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  36.67 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  28.32 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  24.47 
 
 
239 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  25.51 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.92 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  30.47 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1516  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.314298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  33.85 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  37.08 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  37.08 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  37.08 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.13 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  34.44 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  35.96 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  35.96 
 
 
232 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  35.96 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.36 
 
 
147 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0167  LexA repressor  34.44 
 
 
241 aa  48.9  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.139348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  38.89 
 
 
210 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1549  LexA repressor  33.06 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.583013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1398  LexA repressor  35.62 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0394498  hitchhiker  0.000716176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2310  LexA repressor  33.06 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.389414  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.61 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  33.68 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  23.25 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  23.25 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  23.25 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  24.9 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  34.72 
 
 
210 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2172  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  32.18 
 
 
210 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2561  LexA repressor  25.71 
 
 
239 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.936148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  31.03 
 
 
207 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  36.67 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1183  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  25.91 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.186199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1135  LexA repressor  29.35 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.725643  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.61 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  26.36 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  29.11 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  28.31 
 
 
204 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>