36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0240 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  100 
 
 
174 aa  359  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  98.85 
 
 
174 aa  355  1e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  98.28 
 
 
174 aa  353  8e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  76.27 
 
 
177 aa  287  5e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  75.71 
 
 
177 aa  284  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  47.7 
 
 
174 aa  177  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  46.78 
 
 
173 aa  173  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  46.93 
 
 
181 aa  173  1e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  46.93 
 
 
181 aa  173  1e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  47.13 
 
 
178 aa  171  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  38.73 
 
 
176 aa  134  7e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  37.21 
 
 
190 aa  126  1e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  123  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  27.27 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  28.48 
 
 
163 aa  78.6  4e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  27.52 
 
 
154 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  27.2 
 
 
265 aa  53.5  2e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  29.2 
 
 
154 aa  51.2  7e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  28.23 
 
 
265 aa  50.4  1e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  24.84 
 
 
151 aa  50.1  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  27.2 
 
 
265 aa  48.9  3e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  28.23 
 
 
265 aa  48.9  4e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  29.55 
 
 
240 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  24.41 
 
 
240 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  24.41 
 
 
240 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  29.55 
 
 
240 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  22.52 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.03231e-07  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  22.92 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.32 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  22.79 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  21.33 
 
 
166 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  23.24 
 
 
292 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  25.53 
 
 
204 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  25.53 
 
 
204 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  25.53 
 
 
200 aa  41.2  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  22.02 
 
 
162 aa  41.2  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>