48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0126 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00118  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  9.74405e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0121  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0756239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0123  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.5031e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3540  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000680081  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0112  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.7804e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0126  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  8.8286e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00117  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  3.69224e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3483  conserved hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.06382e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0129  hypothetical protein  95.83 
 
 
120 aa  238  3e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040059  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0667  hypothetical protein  89.17 
 
 
120 aa  222  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  5.46212e-09  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0175  hypothetical protein  85.71 
 
 
120 aa  218  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0175  hypothetical protein  85.71 
 
 
120 aa  218  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0413921  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0191  hypothetical protein  85.71 
 
 
120 aa  218  2e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000796415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0183  hypothetical protein  84.87 
 
 
120 aa  216  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811549  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0179  hypothetical protein  84.87 
 
 
120 aa  215  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.58867e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3358  hypothetical protein  70.59 
 
 
119 aa  182  1e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.32345e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1027  hypothetical protein  70.59 
 
 
119 aa  182  1e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3486  hypothetical protein  70.59 
 
 
119 aa  182  1e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  1.45157e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0683  hypothetical protein  70.83 
 
 
120 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0640  hypothetical protein  72.27 
 
 
120 aa  177  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3727  hypothetical protein  70.94 
 
 
119 aa  177  6e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3552  hypothetical protein  70.09 
 
 
119 aa  175  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4007  hypothetical protein  73.5 
 
 
120 aa  158  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0682  hypothetical protein  41.8 
 
 
124 aa  89  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.32631e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3714  hypothetical protein  38.52 
 
 
204 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  6.55627e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0828  hypothetical protein  38.21 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00283176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3837  hypothetical protein  38.52 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  2.98104e-08  hitchhiker  0.00217441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3655  hypothetical protein  37.7 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  9.14261e-11  hitchhiker  1.65817e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3983  hypothetical protein  38.52 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0791  hypothetical protein  38.33 
 
 
195 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.70126e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0826  hypothetical protein  36.89 
 
 
120 aa  83.6  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0655  hypothetical protein  38.52 
 
 
124 aa  80.5  8e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.40297e-09  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3366  hypothetical protein  37.7 
 
 
124 aa  79  2e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.15688e-07  normal  0.0226874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0656  hypothetical protein  37.7 
 
 
124 aa  78.6  3e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.01119e-09  normal  0.209543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0645  hypothetical protein  38.33 
 
 
124 aa  77.4  6e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00602467  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03438  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  76.6  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002571  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  75.5  2e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.60923e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2907  hypothetical protein  35.25 
 
 
123 aa  76.3  2e-13  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0969  hypothetical protein  35.77 
 
 
124 aa  74.7  4e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.58337e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0841  hypothetical protein  34.15 
 
 
124 aa  73.6  9e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.55304e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2591  hypothetical protein  35.54 
 
 
122 aa  73.2  1e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0134  hypothetical protein  32.56 
 
 
126 aa  73.2  1e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.19552e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  64.7  4e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  8.09735e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1513  hypothetical protein  32.26 
 
 
121 aa  63.9  8e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135628  hitchhiker  0.000151477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0928  hypothetical protein  36.89 
 
 
124 aa  62.4  2e-09  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.45839e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1389  hypothetical protein  31.97 
 
 
122 aa  56.6  1e-07  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0703  hypothetical protein  26.36 
 
 
132 aa  54.3  5e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2897  hypothetical protein  22.76 
 
 
123 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.223027  normal  0.377929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>