10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0077 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0077  SgrS RNA  100 
 
 		 226 bp  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0075  hypothetical protein  99.22 
 
 		 132 bp  248  6e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4961  SgrS RNA  98.47 
 
 		 226 bp  244  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3529  conserved hypothetical protein  99.07 
 
 		 132 bp  204  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0119  SgrS RNA  96.97 
 
 		 238 bp  58  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163644  normal  0.42599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0118  SgrS RNA  96.97 
 
 		 238 bp  58  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.165987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0123  SgrS RNA  96.97 
 
 		 238 bp  58  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.980235  normal  0.0251014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0123  SgrS RNA  96.97 
 
 		 238 bp  58  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0116  SgrS RNA  96.97 
 
 		 238 bp  58  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0093    100 
 
 		 73 bp  52  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241468 
 
 
-
 
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