17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0024 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0024  putative fimbrial protein  100 
 
 
177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2386  fimbrial protein  35.2 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.632463  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2297  putative fimbrial subunit protein  34.64 
 
 
176 aa  94  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.801362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2341  putative fimbrial subunit protein  36.22 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2390  putative fimbrial protein protein  35.68 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2498  putative fimbrial subunit protein  35.68 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.399602  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2247  fimbrial protein  27.22 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0358977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1546  Fimbrial protein  26.67 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.358658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1536  fimbrial protein  26.67 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0932  fimbrial protein  26.11 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.85324  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2402  fimbrial protein  26.11 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3094  fimbrial protein  25.56 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.989745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0853  fimbrial protein  25.56 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.548581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00679  predicted fimbrial-like adhesin protein  26.01 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2936  fimbrial protein  26.01 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.545876  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0745  putative type 1 fimbrial protein  26.01 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0767  putative type 1 fimbrial protein  26.01 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>