50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10050 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  99.08 
 
 		 109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  94.5 
 
 		 109 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  88.07 
 
 		 109 aa  201  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  79.82 
 
 		 109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  79.82 
 
 		 109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  79.82 
 
 		 109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  79.82 
 
 		 109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  79.82 
 
 		 109 aa  181  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  78.9 
 
 		 109 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  78.9 
 
 		 109 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  57.8 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  57.8 
 
 		 110 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  57.8 
 
 		 110 aa  137  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  55.56 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  54.63 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  54.63 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  47.75 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  44.55 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  44.55 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  44.55 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  43.64 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  40.37 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  40.38 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  35.19 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  35.19 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  36.11 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  28.7 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  31.82 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  33.04 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  33.33 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  35.05 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  34.09 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  33.33 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  31.82 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  30.49 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  30.91 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2779  Phage minor tail  32.89 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00996028  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  34.21 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1637  Phage minor tail protein  31.58 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  26.67 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3100  minor tail family protein  32.47 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.033574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4061  minor tail family protein  33.7 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5051  minor tail family protein  33.01 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  27.27 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6226  minor tail family protein  28.89 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2201  phage minor tail protein  29.87 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3531  minor tail family protein  28.57 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7020  minor tail family protein  27.78 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>