283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_10021 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  93.52 
 
 		 216 aa  423  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  49.52 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  50.23 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  50.23 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  47.69 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  44.08 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  46.63 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  47.18 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  46.38 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  46.88 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  45.83 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  39.07 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  42.65 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  56.1 
 
 		 133 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  36.06 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  36.99 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  39.27 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  33.98 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  35.81 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  35.38 
 
 		 232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  37.61 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  32.86 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  33.78 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  32.52 
 
 		 235 aa  104  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  36.18 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 209 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  41.79 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2810  putative repressor protein  32.52 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  30.23 
 
 		 224 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 234 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  35.37 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  28.5 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  32.16 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 235 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  41.13 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  56.92 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  45 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  56.92 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  45 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  27.19 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  54.69 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  54.69 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  55.38 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  52.24 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  55.38 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 217 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  55.38 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  55.56 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  55.56 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  31.71 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  25.87 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  40.7 
 
 		 263 aa  72  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  43.37 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  30.23 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0165  hypothetical protein  28.84 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  46.15 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  34.31 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  30.1 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  34.88 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  34.13 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  31.4 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  36.44 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  23.92 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  28.32 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.44 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  41.57 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  36.67 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1179  putative SOS mutagenesis protein UmuD  36.11 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.482422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  35.53 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  33.77 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  33.64 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1183  putative prophage repressor  28.07 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355534  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  32.75 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03030  SOS response transcriptional repressor, RecA-mediated autopeptidase  24.88 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000274718  hitchhiker  1.62281e-36 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  28.04 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  28.04 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  28.04 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1019  XRE family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0426259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  45 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  27.13 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1291  putative SOS mutagenesis protein UmuD  32.41 
 
 		 147 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  40.23 
 
 		 147 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  34.15 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  31.5 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.81 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>