More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03952 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03952  predicted outer membrane factor of efflux pump  100 
 
 
488 aa  995    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3912  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
488 aa  995    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03912  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  995    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  97.95 
 
 
488 aa  976    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3947  putative outer membrane efflux protein MdtP  100 
 
 
488 aa  995    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4325  putative outer membrane efflux protein MdtP  98.16 
 
 
488 aa  978    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4544  putative outer membrane efflux protein MdtP  98.36 
 
 
488 aa  979    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4637  putative outer membrane efflux protein MdtP  98.16 
 
 
488 aa  978    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6556  putative outer membrane efflux protein MdtP  55.28 
 
 
494 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2361  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.58 
 
 
478 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2410  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.58 
 
 
478 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2317  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.58 
 
 
478 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2518  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.58 
 
 
478 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470192  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2406  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.58 
 
 
478 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2738  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  36.02 
 
 
501 aa  283  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2273  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  35.41 
 
 
478 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1509  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  35.41 
 
 
478 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2428  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  35.13 
 
 
478 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0833  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  35.41 
 
 
478 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0905  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  35.41 
 
 
478 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.601202  normal  0.184806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3265  multidrug resistance outer membrane protein MdtQ  35.41 
 
 
478 aa  270  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.028978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02068  predicted outer membrane protein  36.11 
 
 
454 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02026  hypothetical protein  36.81 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1124  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32.55 
 
 
509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.405736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1215  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.69 
 
 
509 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156046  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1294  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  33.94 
 
 
489 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.567151  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1750  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.75 
 
 
498 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0410029 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.8 
 
 
498 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0987986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1287  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.17 
 
 
498 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.193127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1387  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.7 
 
 
498 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.32 
 
 
498 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1481  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.32 
 
 
498 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.32 
 
 
498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590697  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1211  hypothetical protein  31.29 
 
 
496 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1921  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
514 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.330678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1502  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
514 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1745  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
498 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1768  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
493 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1056  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
498 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0170  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
498 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0737823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0996  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.17 
 
 
498 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  30.04 
 
 
519 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1724  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.52 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2815  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  31.18 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449733 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2559  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.54 
 
 
527 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  30.83 
 
 
504 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3744  RND efflux system outer membrane lipoprotein  35.4 
 
 
491 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00975176  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3582  major facilitator superfamily efflux pump outer membrane lipoprotein  30.04 
 
 
502 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.62 
 
 
489 aa  191  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13520  putative outer membrane protein  32.19 
 
 
496 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.620918  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1637  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.09 
 
 
502 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.774452  hitchhiker  0.00150735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.5 
 
 
502 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4022  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.6 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2020  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.37 
 
 
504 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0319738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68120  putative outer membrane protein precursor  29.96 
 
 
492 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00816319  normal  0.0233424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2582  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.54 
 
 
474 aa  186  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.878784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5896  outer membrane protein  31.42 
 
 
490 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.85 
 
 
483 aa  186  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.43 
 
 
499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1700  putative fusaric acid efflux protein  30.06 
 
 
585 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0413  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  30.06 
 
 
582 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783273  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1678  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  30.06 
 
 
594 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6204  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.71 
 
 
490 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0651418  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1854  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  30.06 
 
 
615 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0749  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  30.06 
 
 
582 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3236  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.94 
 
 
480 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125917  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1468  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  30.06 
 
 
576 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0935  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  30.06 
 
 
593 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4460  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.43 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.02 
 
 
509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.244926  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.44 
 
 
514 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1263  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.25 
 
 
509 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.77 
 
 
529 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0929292  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2625  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family protein  30.17 
 
 
601 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.407091  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01155  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 
505 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.269459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1582  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.6 
 
 
515 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4888  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.64 
 
 
482 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595836  normal  0.509529 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.45 
 
 
552 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193594 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0967  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.99 
 
 
525 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1370  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.12 
 
 
515 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1427  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.43 
 
 
505 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1449  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.43 
 
 
505 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0263  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.43 
 
 
517 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140667 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.43 
 
 
517 aa  178  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1331  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.66 
 
 
543 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1854  putative outer membrane multidrug resistance lipoprotein  30.46 
 
 
475 aa  177  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  28.66 
 
 
504 aa  176  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.17 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.248268 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4278  NodT family outer membrane lipoprotein  30.7 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0872817  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2912  hypothetical protein  28.57 
 
 
533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2417  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.73 
 
 
699 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  28.91 
 
 
514 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 
504 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0866  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.23 
 
 
509 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.63 
 
 
604 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1514  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.16 
 
 
483 aa  170  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5575  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 
702 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.52 
 
 
553 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1876  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.52 
 
 
553 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.138949  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3114  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.75 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>