More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03768 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  100 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  100 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  100 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  99.33 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  98.32 
 
 
298 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  85.23 
 
 
298 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  85.23 
 
 
298 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  85.23 
 
 
298 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  85.23 
 
 
298 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  84.9 
 
 
298 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  67 
 
 
298 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  67 
 
 
298 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  67 
 
 
298 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  47.55 
 
 
299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  44.29 
 
 
310 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  37.29 
 
 
306 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  38.21 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  37.28 
 
 
326 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  34.45 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  36.67 
 
 
309 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  36 
 
 
309 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  34.83 
 
 
312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  33.79 
 
 
309 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 
298 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  35.84 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  37.84 
 
 
282 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  33.33 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  34.95 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  26.77 
 
 
308 aa  120  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  35.12 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  33.01 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  28.57 
 
 
304 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  33.79 
 
 
304 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  32.43 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  29.61 
 
 
308 aa  113  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  34.35 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  32.44 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  28.52 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  28.52 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  28.52 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  28.52 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  28.52 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  32.99 
 
 
313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.63 
 
 
307 aa  109  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  31.39 
 
 
308 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  30.25 
 
 
313 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  27.57 
 
 
345 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 
318 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  29.77 
 
 
305 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
304 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  29.73 
 
 
307 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  31.8 
 
 
308 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  31.8 
 
 
308 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  31.8 
 
 
308 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  28.06 
 
 
311 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  32.08 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  29.1 
 
 
301 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  30.62 
 
 
308 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  30.41 
 
 
313 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  31.29 
 
 
312 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 
305 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  30.61 
 
 
310 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  29.87 
 
 
298 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  29.84 
 
 
314 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  29.87 
 
 
298 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  30.19 
 
 
298 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  28.57 
 
 
309 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  29.87 
 
 
298 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  29.87 
 
 
298 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  29.55 
 
 
298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  29.55 
 
 
298 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.85 
 
 
295 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  26.91 
 
 
310 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  29.22 
 
 
298 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  29.51 
 
 
307 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  31.4 
 
 
308 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  29.22 
 
 
298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.39 
 
 
308 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  27.78 
 
 
304 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  27.78 
 
 
304 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  30.48 
 
 
302 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  32.65 
 
 
313 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  27.54 
 
 
294 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  30.46 
 
 
308 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  29.63 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  30.59 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  30.86 
 
 
328 aa  99  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  31.41 
 
 
318 aa  99  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  25.91 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  28.71 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  31.4 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  33.01 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  28.71 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  26.69 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.06 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  30.16 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  31.21 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  29.13 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.92 
 
 
325 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>