230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03569 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03569  heat shock chaperone  100 
 
 
133 aa  275  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
142 aa  274  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  274  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  274  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  274  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  274  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  274  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
142 aa  274  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  99.25 
 
 
142 aa  272  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  88.72 
 
 
142 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  88.72 
 
 
142 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  88.72 
 
 
142 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  88.72 
 
 
142 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  88.72 
 
 
142 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  81.2 
 
 
142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  64.66 
 
 
150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0035  heat shock chaperone IbpB  64.66 
 
 
149 aa  180  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4104  heat shock chaperone IbpB  64.62 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0049  heat shock chaperone IbpB  58.65 
 
 
142 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.206343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0012  heat shock chaperone IbpB  60.8 
 
 
154 aa  166  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3794  heat shock chaperone IbpB  60.8 
 
 
154 aa  166  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4142  heat shock chaperone IbpB  60.8 
 
 
154 aa  166  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3913  heat shock chaperone IbpB  60.16 
 
 
149 aa  166  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  45.99 
 
 
147 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  45.26 
 
 
149 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2170  heat shock protein, Hsp20 family  42.34 
 
 
147 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  44.53 
 
 
147 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2726  heat shock protein Hsp20  47.45 
 
 
160 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.239135  normal  0.135003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1980  heat shock protein Hsp20  42.96 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168332  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  44.53 
 
 
147 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  44.03 
 
 
155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  45.32 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  44.36 
 
 
147 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3321  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3620  heat shock protein Hsp20  43.18 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  44.6 
 
 
149 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  45.59 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  47.66 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34300  heat shock protein IbpA  46.76 
 
 
147 aa  114  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  46.51 
 
 
147 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  46.51 
 
 
147 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  46.51 
 
 
147 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  43.26 
 
 
152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  44.85 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  44.12 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2746  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
168 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  45.59 
 
 
145 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  43.2 
 
 
147 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  40.46 
 
 
148 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  46.88 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  46.88 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  46.88 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  46.88 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38610  heat shock protein Hsp20  42.55 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  46.88 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  45.24 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3580  chaperone protein IbpA  41.55 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1883  heat shock protein Hsp20  42.22 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  47.29 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  45.26 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.11 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  41.67 
 
 
154 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  44.53 
 
 
137 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1668  small heat shock protein IbpA (16 kDa heat shock protein A)  44.19 
 
 
139 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.172487  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  41.79 
 
 
156 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  43.85 
 
 
160 aa  110  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
156 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
156 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  38.35 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  40.94 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  43.38 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  44.88 
 
 
148 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  44.19 
 
 
160 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  37.98 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2676  heat shock protein Hsp20  37.98 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.983147  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  40.31 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3795  heat shock protein IbpA  43.31 
 
 
137 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0011  heat shock protein IbpA  43.31 
 
 
137 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
167 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4143  heat shock protein IbpA  43.31 
 
 
137 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  40.31 
 
 
153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  41.09 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  41.09 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  42.65 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  40.46 
 
 
155 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
156 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  41.73 
 
 
141 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  40.62 
 
 
158 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>