More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03337 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  100 
 
 
355 aa  701    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  99.72 
 
 
355 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3686  MFP family transporter  99.72 
 
 
355 aa  698    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3835  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  98.87 
 
 
355 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  99.72 
 
 
355 aa  698    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  99.72 
 
 
355 aa  700    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  701    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
355 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3960  secretion protein HlyD family protein  86.76 
 
 
355 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3899  secretion protein HlyD family protein  87.61 
 
 
355 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3856  auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  87.32 
 
 
355 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3779  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  87.32 
 
 
355 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3789  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  87.04 
 
 
355 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  57.22 
 
 
354 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  57.75 
 
 
357 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  56.86 
 
 
382 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  60 
 
 
358 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  60.76 
 
 
352 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  59.32 
 
 
357 aa  368  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  57.49 
 
 
356 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1038  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  59.47 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2775  type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  59.47 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2632  putative efflux transporter, MFP subunit  59.47 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0439  Type I antifreeze protein:HlyD family secretion protein  59.76 
 
 
357 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2179  secretion protein HlyD family protein  56.1 
 
 
467 aa  354  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  56.76 
 
 
357 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  54.91 
 
 
359 aa  348  7e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0169  secretion protein HlyD  54.85 
 
 
356 aa  346  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1685  secretion protein HlyD  58.5 
 
 
355 aa  345  5e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00216281  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  56.44 
 
 
363 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  54.52 
 
 
355 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  59.04 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  54.49 
 
 
357 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1433  secretion protein HlyD  56.19 
 
 
358 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3969  MFP family transporter  99.49 
 
 
284 aa  335  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1351  HlyD family secretion protein  54.23 
 
 
355 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  57.76 
 
 
357 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1309  HlyD family secretion protein  54.23 
 
 
391 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  54.17 
 
 
357 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  55.12 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  54.76 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0171  secretion protein HlyD  54.65 
 
 
356 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4665  secretion protein HlyD  55.25 
 
 
356 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.157794 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4916  secretion protein HlyD family protein  54.52 
 
 
356 aa  311  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3661  HlyD family secretion protein  52.76 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650458  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  51.61 
 
 
350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2360  secretion protein HlyD family protein  56.27 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.451322  normal  0.672281 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1498  secretion protein HlyD family protein  56.27 
 
 
356 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0017  secretion protein HlyD family protein  49.71 
 
 
332 aa  282  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1152  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 
355 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.162032  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4685  secretion protein HlyD family protein  53.05 
 
 
429 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.189935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0748  secretion protein HlyD family protein  47.11 
 
 
343 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0153902  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  41.69 
 
 
365 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  42.33 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 
350 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  41.52 
 
 
351 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0211  secretion protein HlyD family protein  43.83 
 
 
331 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 
339 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  45.12 
 
 
343 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1310  hypothetical protein  70.81 
 
 
161 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3791  secretion protein HlyD family protein  44.38 
 
 
348 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  41.69 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1560  secretion protein HlyD family protein  41.05 
 
 
341 aa  233  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  40.95 
 
 
321 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  41.99 
 
 
356 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  42.43 
 
 
328 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4846  secretion protein HlyD family protein  43.5 
 
 
332 aa  225  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.173931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  41.82 
 
 
341 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0082  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 
437 aa  219  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  41.83 
 
 
321 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5267  secretion protein HlyD family protein  44.04 
 
 
319 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.777645  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  43.73 
 
 
319 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3160  HlyD family membrane fusion protein  43.3 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3897  secretion protein HlyD family protein  43.3 
 
 
331 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.405047  normal  0.316887 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3217  NapC/NirT cytochrome c domain-containing protein  43.79 
 
 
331 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.717243  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5751  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 
332 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320621  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  34.58 
 
 
335 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0096  secretion protein HlyD  34.44 
 
 
321 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  27.96 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  32.67 
 
 
335 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  32.1 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.72 
 
 
329 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1311  hypothetical protein  48.92 
 
 
195 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 
425 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2810  secretion protein HlyD family protein  28.4 
 
 
368 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.653473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  31.65 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  31.65 
 
 
328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  28.84 
 
 
395 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  34.53 
 
 
333 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.52 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  36.56 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  30.61 
 
 
354 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.49 
 
 
333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33.11 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1493  secretion protein HlyD family protein  28.9 
 
 
332 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.172966  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.93 
 
 
353 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  32.64 
 
 
340 aa  109  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>