More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03276 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 108 aa  227  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 108 aa  227  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 108 aa  227  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  227  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 108 aa  227  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  99.07 
 
 		 108 aa  226  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  99.07 
 
 		 108 aa  226  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  99.07 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  99.07 
 
 		 108 aa  224  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  81.13 
 
 		 110 aa  190  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  81.48 
 
 		 108 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  81.48 
 
 		 108 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  81.48 
 
 		 108 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  81.48 
 
 		 108 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  81.48 
 
 		 108 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 109 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 109 aa  154  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  66.67 
 
 		 109 aa  154  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  64.81 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  64.29 
 
 		 106 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  60.58 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  61.39 
 
 		 107 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  62.24 
 
 		 106 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 		 106 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  58.49 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  57.94 
 
 		 106 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  60.4 
 
 		 106 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  56.6 
 
 		 106 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  56.07 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  50.47 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  51.85 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  51.4 
 
 		 109 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  49.07 
 
 		 110 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  53.61 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  48.6 
 
 		 106 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  49.53 
 
 		 109 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  49.06 
 
 		 110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  46.6 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  47.66 
 
 		 106 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  45.19 
 
 		 106 aa  103  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  45.79 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  47.96 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  51.76 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  47.96 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  47.96 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  46.46 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  44.9 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  44.9 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  47.62 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  51.32 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  43.43 
 
 		 101 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  48.57 
 
 		 103 aa  87  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  44.71 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  36.36 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 656 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  41.05 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 263 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.77 
 
 		 245 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  40.43 
 
 		 113 aa  70.1  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  35.11 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  31.31 
 
 		 272 aa  67.4  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  38.37 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  35.87 
 
 		 261 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  31.91 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  29.59 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.3 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.32 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  30.48 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  30.85 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  29.35 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  31 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  32.29 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>