57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03182 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  99.49 
 
 
195 aa  393  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  28.27 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  27.37 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  28.14 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  28.08 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  24.88 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  26.02 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  26.42 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  25.7 
 
 
237 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  28.16 
 
 
237 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  26.63 
 
 
253 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  26.64 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  26.63 
 
 
253 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  28.24 
 
 
246 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  26.29 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  24.62 
 
 
259 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  23.86 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  25 
 
 
236 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  25.11 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  28.97 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  23.62 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  29.41 
 
 
223 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  28.78 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  24.74 
 
 
201 aa  52  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  24.42 
 
 
259 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  24.42 
 
 
259 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  29 
 
 
239 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  24.42 
 
 
263 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  23.98 
 
 
257 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  37.88 
 
 
221 aa  52  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  25 
 
 
254 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  25.46 
 
 
251 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  24.74 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  24.75 
 
 
264 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  24.74 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  24.66 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  25.51 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  25.98 
 
 
252 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  24.75 
 
 
259 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  23.68 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  25.98 
 
 
208 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  26.92 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 
291 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  24.74 
 
 
250 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  36 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  26.6 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  26.89 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  30.51 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  27.54 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  26.81 
 
 
213 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0903  hypothetical protein  39.29 
 
 
94 aa  41.2  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  34.78 
 
 
198 aa  41.2  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>