76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02831 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  100 
 
 
311 aa  631  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  9.02301e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  99.68 
 
 
325 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  5.53793e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  98.71 
 
 
325 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  98.07 
 
 
325 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  98 
 
 
325 aa  572  1e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  40.06 
 
 
336 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  39.74 
 
 
336 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  40.33 
 
 
336 aa  221  2e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  36.07 
 
 
339 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  39.23 
 
 
327 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  34.38 
 
 
332 aa  190  3e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  33.86 
 
 
332 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  34.17 
 
 
362 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  33.54 
 
 
332 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  33.86 
 
 
332 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  33.86 
 
 
332 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  34.18 
 
 
332 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  34.49 
 
 
332 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  34.49 
 
 
332 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  34.18 
 
 
324 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  33.54 
 
 
332 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  34.18 
 
 
332 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  32.38 
 
 
326 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  32.91 
 
 
328 aa  179  5e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  33.99 
 
 
334 aa  174  3e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  32.08 
 
 
333 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  36.59 
 
 
325 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  33.55 
 
 
328 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  32.57 
 
 
328 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  29.81 
 
 
358 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  30.53 
 
 
334 aa  139  5e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  28.57 
 
 
345 aa  134  1e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  27.64 
 
 
371 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  35.44 
 
 
327 aa  127  2e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  35.44 
 
 
327 aa  127  2e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  35.44 
 
 
327 aa  127  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.61941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  35.44 
 
 
327 aa  127  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  35.44 
 
 
327 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  28.53 
 
 
356 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  29.93 
 
 
333 aa  124  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  34.07 
 
 
328 aa  117  2e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  34.67 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  27.36 
 
 
332 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  28.88 
 
 
354 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  26.21 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  26.55 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  30.53 
 
 
324 aa  83.6  4e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  33.17 
 
 
321 aa  80.9  2e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  31.88 
 
 
321 aa  80.5  3e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  31.88 
 
 
321 aa  79.7  5e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1409  general secretion pathway protein K  28.96 
 
 
292 aa  76.6  5e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0046886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  28.62 
 
 
318 aa  75.5  1e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  27.18 
 
 
304 aa  74.7  2e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  29.95 
 
 
321 aa  73.6  4e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  25.67 
 
 
320 aa  72.4  8e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  26.56 
 
 
315 aa  61.6  2e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  27.01 
 
 
357 aa  61.6  2e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  28.29 
 
 
272 aa  60.5  3e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.00427e-06 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  27.6 
 
 
265 aa  60.5  3e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  40.24 
 
 
281 aa  57.4  3e-07  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  22.48 
 
 
306 aa  55.8  1e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1309  type II secretory pathway protein  28.57 
 
 
322 aa  53.9  3e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  39.02 
 
 
281 aa  54.3  3e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  22.79 
 
 
301 aa  53.5  4e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  26.15 
 
 
294 aa  52.8  8e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1312  type II secretory pathway protein  28.25 
 
 
322 aa  52.4  1e-05  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  21.94 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  23.62 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0959  general secretion pathway protein K  22.02 
 
 
318 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1011  general secretion pathway protein K  22.02 
 
 
318 aa  46.2  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  35.29 
 
 
283 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  23.04 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1036  Type II secretory pathway component PulK-like protein  23.58 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.588602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2389  general secretion pathway protein K  25.13 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1081  general secretion pathway protein K  24.19 
 
 
331 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  25.24 
 
 
362 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>