15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02826 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  904  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.01247e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  945  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.63468e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  28.16 
 
 
586 aa  118  2e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  27.51 
 
 
608 aa  115  2e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  28.93 
 
 
564 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  25.14 
 
 
564 aa  109  9e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  26.52 
 
 
569 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  27.51 
 
 
576 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  25.71 
 
 
581 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  29.91 
 
 
551 aa  90.9  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26.39 
 
 
588 aa  86.7  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  27.41 
 
 
419 aa  85.5  2e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  29.41 
 
 
379 aa  64.7  4e-09  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  2.64009e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  29.41 
 
 
379 aa  64.7  4e-09  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.36217e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14700  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  25.13 
 
 
394 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.10897e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>