85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02815 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02815  Capsule polysaccharide export inner-membrane protein kpsE  100 
 
 
378 aa  773  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.39035e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3220  polysialic acid capsule export inner-membrane protein KpsE  99.47 
 
 
382 aa  770  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02765  hypothetical protein  99.74 
 
 
382 aa  773  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.09995e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0622  capsular polysaccharide ABC transporter  38.53 
 
 
367 aa  275  1e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.22942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3904  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.93 
 
 
368 aa  239  6e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.122006 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  34.76 
 
 
372 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  35.04 
 
 
372 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  35.04 
 
 
372 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  34.38 
 
 
371 aa  219  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2610  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.87 
 
 
373 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3238  lipopolysaccharide biosynthesis  30.29 
 
 
483 aa  197  4e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  29.05 
 
 
372 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1304  chain length determinant protein  30.56 
 
 
360 aa  184  2e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4939  lipopolysaccharide biosynthesis  30.12 
 
 
387 aa  175  2e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5730  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein  30.95 
 
 
368 aa  174  2e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2583  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.35 
 
 
436 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  1.74654e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5953  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.84 
 
 
383 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2756  capsule polysaccharide export protein-like  28.12 
 
 
400 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.415519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001782  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  26.99 
 
 
381 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1658  capsule polysaccharide export protein-like protein  28.41 
 
 
413 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3869  capsule polysaccharide export protein-like  26.29 
 
 
380 aa  141  2e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4566  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.99 
 
 
448 aa  139  9e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0295  lipopolysaccharide biosynthesis  26.84 
 
 
382 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0778  lipopolysaccharide biosynthesis  26.84 
 
 
382 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4871  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.33 
 
 
433 aa  134  4e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.34888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4996  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.59 
 
 
443 aa  132  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0773002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4014  capsule polysaccharide export-like protein  23.23 
 
 
387 aa  132  1e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3812  capsule polysaccharide export protein-like protein  24.23 
 
 
416 aa  131  2e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.879511  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4453  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.14 
 
 
448 aa  131  2e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.401301  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4085  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.14 
 
 
448 aa  131  2e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160773  normal  0.368018 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3300  WcbD  25.56 
 
 
465 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0873208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1507  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 
369 aa  129  7e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3253  capsule polysaccharide exporter  25.56 
 
 
515 aa  129  9e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.51682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3288  capsule polysaccharide exporter  25.56 
 
 
515 aa  129  9e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1077  capsule polysaccharide exporter  25.56 
 
 
515 aa  129  9e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0522  capsule polysaccharide exporter  25.56 
 
 
515 aa  129  9e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122363  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2184  capsule polysaccharide exporter  25.56 
 
 
515 aa  129  9e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4085  capsule polysaccharide export protein-like  25.56 
 
 
379 aa  129  1e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.387523  normal  0.315996 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1337  WcbD  27 
 
 
388 aa  128  2e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2346  lipopolysaccharide biosynthesis  25.26 
 
 
399 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1522  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.42 
 
 
385 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0713  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.42 
 
 
415 aa  127  4e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3838  capsule polysaccharide export protein  26.89 
 
 
611 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2961  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  25.93 
 
 
371 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2574  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 
371 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2049  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.93 
 
 
413 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2731  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
394 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5579  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.36 
 
 
413 aa  122  1e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.906457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1150  WcbD  27.68 
 
 
388 aa  122  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0184519  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2721  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.28 
 
 
411 aa  121  2e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2037  polysaccharide ABC transporter  28.7 
 
 
402 aa  118  1e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.126428  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0746  capsule polysaccharide export inner-membrane protein  23.38 
 
 
365 aa  119  1e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5053  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 
436 aa  119  1e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.522241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1852  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
433 aa  117  4e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0775  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.14 
 
 
414 aa  116  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.069247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0816  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.14 
 
 
414 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.671336  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0435  capsule polysaccharide export protein-like protein  25.7 
 
 
413 aa  114  2e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00121431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6013  capsule polysaccharide export protein-like protein  27.99 
 
 
421 aa  112  7e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5038  capsule polysaccharide export protein-like  24.78 
 
 
413 aa  112  1e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0654  capsule polysaccharide export protein-like  24.57 
 
 
585 aa  111  2e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0737  capsule polysaccharide export protein-like protein  26.01 
 
 
414 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2126  capsule polysaccharide export protein-like  25.07 
 
 
652 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0747  WcbD  24.37 
 
 
390 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0632  polysaccharide ABC transporter  28.63 
 
 
403 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0379195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0584  capsule polysaccharide export  23.48 
 
 
569 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2722  capsule polysaccharide export protein-like protein  22.44 
 
 
432 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1234  capsule polysaccharide export protein-like  24.83 
 
 
579 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195673  normal  0.85548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3819  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
442 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.670333  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3997  hypothetical protein  22.93 
 
 
492 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.740683  normal  0.827295 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4076  capsule polysaccharide export protein  24.72 
 
 
491 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.054878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0711  Capsule polysaccharide export protein  21.57 
 
 
415 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3817  capsule polysaccharide export protein-like protein  22.25 
 
 
430 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.141093  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2087  capsule polysaccharide export protein-like protein  22.15 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3657  capsule polysaccharide export protein-like  25.15 
 
 
590 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2082  capsule polysaccharide export-like protein  21.94 
 
 
407 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0722  putative capsule polysaccharide export ABC transporter transmembrane protein  21.18 
 
 
385 aa  85.9  1e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0662  putative capsule polysaccharide export inner-membrane protein CtrB  21.51 
 
 
391 aa  78.6  2e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0904257  normal  0.0442626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  23.51 
 
 
428 aa  57.8  3e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  22.1 
 
 
406 aa  50.4  5e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  24.68 
 
 
388 aa  49.7  8e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  20.55 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  26.35 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  26.35 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  26.35 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  25.68 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>