More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02740 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  91.78 
 
 
438 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  77.75 
 
 
441 aa  711  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  82.26 
 
 
437 aa  751  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.38921e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  92.01 
 
 
438 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  76.89 
 
 
437 aa  714  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.3495e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  99.77 
 
 
441 aa  914  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.2463e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  85.78 
 
 
437 aa  790  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  99.09 
 
 
441 aa  906  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  100 
 
 
441 aa  914  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.06171e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  82.49 
 
 
437 aa  752  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.95662e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  91.78 
 
 
438 aa  845  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  100 
 
 
441 aa  914  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.02485e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  98.87 
 
 
441 aa  907  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  99.09 
 
 
441 aa  906  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.00618e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  100 
 
 
441 aa  914  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.20398e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  82.49 
 
 
437 aa  752  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  91.55 
 
 
438 aa  846  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  100 
 
 
441 aa  914  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  9.20962e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  77.65 
 
 
441 aa  711  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  99.32 
 
 
441 aa  909  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.64237e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  77.88 
 
 
441 aa  712  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  77.8 
 
 
442 aa  714  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  92.01 
 
 
438 aa  848  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  51.69 
 
 
439 aa  464  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  51.14 
 
 
443 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  50.8 
 
 
437 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  49.07 
 
 
439 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  49.44 
 
 
444 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  49.44 
 
 
444 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  49.66 
 
 
444 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  49.31 
 
 
444 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  45.7 
 
 
461 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  47.17 
 
 
444 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  47.26 
 
 
439 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  46.73 
 
 
444 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  47.24 
 
 
436 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  47.24 
 
 
436 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  46.95 
 
 
444 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  48.49 
 
 
436 aa  401  1e-110  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  46.83 
 
 
444 aa  399  1e-110  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  47.06 
 
 
444 aa  400  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  46.83 
 
 
444 aa  398  1e-110  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  47.52 
 
 
444 aa  401  1e-110  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  47.13 
 
 
439 aa  398  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  48.16 
 
 
454 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  47.18 
 
 
446 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  1.18983e-07 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  45.88 
 
 
458 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  47.18 
 
 
446 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  43.58 
 
 
443 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  46.9 
 
 
454 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  3.54037e-08 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  46.17 
 
 
440 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  48.75 
 
 
445 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  45.76 
 
 
499 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  45.77 
 
 
439 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  1.08006e-07 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  47.31 
 
 
441 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  45.16 
 
 
439 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  45.54 
 
 
439 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  47.02 
 
 
436 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  45.41 
 
 
443 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  46.33 
 
 
455 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  44.62 
 
 
459 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  43.88 
 
 
462 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  43.42 
 
 
454 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  44.04 
 
 
458 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  45.09 
 
 
468 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  44.65 
 
 
474 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  44.54 
 
 
514 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  44.59 
 
 
465 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  45.75 
 
 
437 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  44.02 
 
 
473 aa  365  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  41.37 
 
 
464 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  41.15 
 
 
464 aa  359  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  43.32 
 
 
436 aa  358  8e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  41.61 
 
 
462 aa  356  6e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  45.12 
 
 
414 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  41.06 
 
 
461 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  41.74 
 
 
435 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  43.05 
 
 
642 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  41.28 
 
 
461 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  43.05 
 
 
469 aa  353  3e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  43.21 
 
 
611 aa  353  3e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  42.83 
 
 
481 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  42.83 
 
 
468 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  42.83 
 
 
481 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  42.83 
 
 
481 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  43.55 
 
 
436 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  45.2 
 
 
433 aa  349  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  43.19 
 
 
432 aa  349  5e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  41.94 
 
 
461 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  42.6 
 
 
469 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  41.94 
 
 
461 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  41.94 
 
 
461 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  45.56 
 
 
446 aa  346  6e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  41.24 
 
 
464 aa  343  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  44.98 
 
 
442 aa  343  5e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  44.75 
 
 
442 aa  340  3e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  44.5 
 
 
439 aa  337  3e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  41.76 
 
 
435 aa  337  3e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  44.5 
 
 
439 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  43.81 
 
 
439 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>