295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02622 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.86823e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.77114e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.74492e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  99.55 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.74693e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  6.38386e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.63859e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3099  hypothetical protein  99.55 
 
 
223 aa  465  1e-130  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.09551e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  4.88158e-08  normal  0.75822 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  466  1e-130  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.03902e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3148  radical SAM domain-containing protein  95.96 
 
 
223 aa  453  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000734892  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3265  radical SAM domain-containing protein  95.96 
 
 
223 aa  453  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  2.5013e-05  normal  0.189038 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3084  radical SAM domain protein  95.96 
 
 
223 aa  453  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  2.55818e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3167  hypothetical protein  95.96 
 
 
223 aa  453  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.57264e-05  normal  0.548962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  95.52 
 
 
223 aa  451  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  1.08893e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3229  radical SAM domain-containing protein  91.03 
 
 
223 aa  434  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  6.24181e-07  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  80.72 
 
 
223 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0808  radical SAM domain-containing protein  81.17 
 
 
223 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  80.27 
 
 
223 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0977  radical SAM domain-containing protein  79.37 
 
 
223 aa  384  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3444  radical SAM domain-containing protein  79.37 
 
 
223 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3313  radical SAM domain-containing protein  79.37 
 
 
223 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.566212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0822  hypothetical protein  78.03 
 
 
223 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0856  hypothetical protein  77.03 
 
 
224 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0220  hypothetical protein  65.47 
 
 
223 aa  310  1e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0978  hypothetical protein  62.9 
 
 
245 aa  292  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003398  queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM  63.35 
 
 
226 aa  291  8e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.593414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2501  radical activating enzyme  60.81 
 
 
222 aa  289  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2163  radical activating enzyme  60.81 
 
 
222 aa  289  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224373  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1917  radical activating enzyme  60.81 
 
 
222 aa  288  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0152798  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1855  radical activating enzyme  60.36 
 
 
222 aa  288  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.328449  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2058  radical activating enzyme  60.81 
 
 
222 aa  287  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00725057  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0580  hypothetical protein  60.18 
 
 
226 aa  284  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.894879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2162  radical activating enzyme  59.01 
 
 
222 aa  283  1e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.221208  normal  0.837279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2268  radical activating enzyme  59.01 
 
 
222 aa  282  2e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00320351  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2116  radical activating enzyme  58.56 
 
 
222 aa  283  2e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.054229  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4540  hypothetical protein  59.01 
 
 
222 aa  283  2e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2254  radical activating enzyme  59.01 
 
 
222 aa  283  2e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.499803  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2061  radical SAM domain-containing protein  59.46 
 
 
222 aa  281  4e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02724  radical activating enzyme  59.17 
 
 
224 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02385  hypothetical protein  62.04 
 
 
216 aa  277  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2049  radical activating enzyme  57.66 
 
 
222 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.341171  normal  0.258883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2014  radical activating enzyme  57.66 
 
 
222 aa  273  1e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2551  radical activating enzyme  57.21 
 
 
222 aa  271  4e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92162  normal  0.0345357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1825  radical activating enzyme  58.82 
 
 
233 aa  271  4e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.40401  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1100  radical SAM domain-containing protein  58.82 
 
 
246 aa  270  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.256897  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  57.4 
 
 
222 aa  269  3e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2348  radical SAM domain-containing protein  57.66 
 
 
222 aa  268  6e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1877  radical activating enzyme  54.5 
 
 
222 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.460246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2960  radical SAM family protein  56.31 
 
 
248 aa  266  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2947  hypothetical protein  55.45 
 
 
226 aa  258  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.500667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6259  Radical SAM domain protein  47.37 
 
 
230 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  47.96 
 
 
235 aa  214  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2236  organic radical activating protein  35.29 
 
 
205 aa  118  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1319  Radical SAM domain protein  35.75 
 
 
210 aa  116  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  37.22 
 
 
207 aa  117  2e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  33.05 
 
 
225 aa  117  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29591  putative organic radical activating protein  32.64 
 
 
226 aa  114  9e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18811  putative organic radical activating protein  35 
 
 
223 aa  114  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.533025  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1715  organic radical activating enzyme  33.94 
 
 
205 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0221743  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06800  hypothetical protein  33.94 
 
 
210 aa  113  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0516243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2599  organic radical activating protein  35.43 
 
 
205 aa  112  4e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.836809  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18221  putative organic radical activating protein  33.88 
 
 
226 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6932  hypothetical protein  35.96 
 
 
209 aa  110  1e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1782  organic radical activating enzyme  32.42 
 
 
216 aa  110  2e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330721  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0659  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
210 aa  110  2e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.917391  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1332  hypothetical protein  33.18 
 
 
206 aa  110  2e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0487  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 
210 aa  109  4e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2067  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 
207 aa  106  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0974345  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  34.7 
 
 
193 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1145  radical activating enzyme  32.43 
 
 
205 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.723359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  33.92 
 
 
195 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1116  hypothetical protein  31.98 
 
 
205 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18811  putative organic radical activating protein  30.64 
 
 
223 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19001  putative organic radical activating protein  31.06 
 
 
225 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.843472  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21641  putative organic radical activating protein  33.48 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1292  putative organic radical activating protein  33.48 
 
 
213 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0318  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 
210 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 
192 aa  95.5  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4406  hypothetical protein  35.19 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3115  organic radical activating enzyme-like protein  34.04 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.369286  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2504  organic radical activating enzymes-like  33.89 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3134  organic radical activating enzyme-like protein  33.89 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.260686 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3118  organic radical activating enzymes-like protein  33.89 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2285  hypothetical protein  34.31 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2794  hypothetical protein  34.31 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0162  organic radical activating protein  34.31 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2364  hypothetical protein  34.31 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0357  GntS  34.31 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0153  hypothetical protein  34.31 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3056  organic radical activating enzyme-like protein  34.04 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133958  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3173  organic radical activating enzyme-like protein  34.04 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.655462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0044  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2614  organic radical activating-like protein  34.05 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  39.86 
 
 
258 aa  91.7  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0172  hypothetical protein  34.31 
 
 
210 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.196863  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 
210 aa  91.3  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6469  organic radical activating-like protein  33.62 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0138  hypothetical protein  33.75 
 
 
210 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.620978  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2111  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
211 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1198  hypothetical protein  32.35 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.792067  normal  0.949639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>