30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02621 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  575  1e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  6.59923e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3082  hypothetical protein  54.76 
 
 
140 aa  116  4e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.03876e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2880  hypothetical protein  55.68 
 
 
103 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  34.07 
 
 
238 aa  84.7  2e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2916  hypothetical protein  51.82 
 
 
122 aa  77.4  2e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.44529e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0166  hypothetical protein  36.65 
 
 
173 aa  73.2  5e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  40.44 
 
 
137 aa  71.2  2e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1373  hypothetical protein  36.64 
 
 
160 aa  71.2  2e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00827993  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1370  hypothetical protein  32.35 
 
 
134 aa  60.8  2e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103597  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2893  hypothetical protein  52.63 
 
 
86 aa  59.3  7e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1367  hypothetical protein  30.29 
 
 
181 aa  58.9  9e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1366  hypothetical protein  38.04 
 
 
104 aa  57.4  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0265847  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3247  hypothetical protein  59.18 
 
 
51 aa  55.1  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.235379  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1255  hypothetical protein  29.47 
 
 
197 aa  54.3  2e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0983588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1586  hypothetical protein  32.9 
 
 
218 aa  54.7  2e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.344958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00875  hypothetical protein  36.84 
 
 
150 aa  53.9  3e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1253  hypothetical protein  28.81 
 
 
443 aa  50.4  4e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2917  hypothetical protein  52.94 
 
 
56 aa  50.1  4e-05  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.37281e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0790  hypothetical protein  27.36 
 
 
275 aa  49.7  5e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1369  hypothetical protein  37.62 
 
 
102 aa  50.1  5e-05  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0323881  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2936  hypothetical protein  29.61 
 
 
306 aa  49.7  5e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1252  hypothetical protein  32.92 
 
 
194 aa  49.7  6e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0167  hypothetical protein  37.36 
 
 
99 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2937  hypothetical protein  31.82 
 
 
150 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.966639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1963  hypothetical protein  32.35 
 
 
247 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154391  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1371  hypothetical protein  36.99 
 
 
78 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794296  normal  0.849954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1584  hypothetical protein  27.54 
 
 
351 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3146  hypothetical protein  67.74 
 
 
40 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3090  hypothetical protein  69.7 
 
 
44 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00874  hypothetical protein  46.15 
 
 
61 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>