More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02482 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0954  ATP-dependent chaperone ClpB  56.06 
 
 
872 aa  964  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3145  ATP-dependent chaperone ClpB  71.9 
 
 
861 aa  1253  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.263626  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4921  ATP-dependent chaperone ClpB  58.53 
 
 
879 aa  988  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289151  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1585  ATP-binding subunit of Clp protease  53.52 
 
 
889 aa  912  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1996  ATP-dependent chaperone ClpB  53.7 
 
 
866 aa  916  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3729  ATP-dependent chaperone ClpB  58.57 
 
 
874 aa  1001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2302  ATP-dependent chaperone ClpB  58.5 
 
 
874 aa  1002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.409555  normal  0.0500216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02158  ATP-dependent chaperone ClpB  70.09 
 
 
898 aa  1233  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.46606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1210  ATP-dependent chaperone ClpB  67.33 
 
 
862 aa  1146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.890836  normal  0.0751244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1813  ATP-dependent chaperone ClpB  66.74 
 
 
865 aa  1172  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.264392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2973  protein disaggregation chaperone  99.88 
 
 
857 aa  1731  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  8.39096e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0836  ATP-dependent chaperone ClpB  55.52 
 
 
860 aa  925  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00212148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0938  ATP-dependent chaperone ClpB  67.21 
 
 
865 aa  1179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.651137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0823  ATP-dependent chaperone ClpB  60 
 
 
865 aa  1003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457177  normal  0.714446 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1779  ATP-dependent chaperone ClpB  69.54 
 
 
861 aa  1214  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.772911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1950  ATP-dependent chaperone ClpB  54.13 
 
 
872 aa  918  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1757  ATP-dependent chaperone ClpB  66.24 
 
 
865 aa  1165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.786862  normal  0.0714253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2875  protein disaggregation chaperone  96.73 
 
 
857 aa  1684  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0261758  normal  0.114716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2877  protein disaggregation chaperone  96.85 
 
 
857 aa  1685  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0185165  normal  0.16875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2856  protein disaggregation chaperone  96.73 
 
 
857 aa  1684  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448929  normal  0.22616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0009  ATP-dependent chaperone ClpB  54.22 
 
 
888 aa  898  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1223  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  53.83 
 
 
866 aa  914  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1907  ATP-dependent chaperone ClpB  60.84 
 
 
864 aa  1014  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3270  ATP-dependent chaperone ClpB  78.18 
 
 
857 aa  1365  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  9.97344e-05  normal  0.063711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2646  ATP-dependent chaperone ClpB  66.63 
 
 
860 aa  1147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.17 
 
 
866 aa  912  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3521  ATP-dependent chaperone ClpB  58.55 
 
 
866 aa  988  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0824402  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1762  ATP-dependent chaperone ClpB  57.58 
 
 
867 aa  988  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3833  protein disaggregation chaperone  100 
 
 
857 aa  1733  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.68048e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0666  chaperone ClpB (heat-shock protein)  75.38 
 
 
861 aa  1345  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00205546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1638  ATP-dependent chaperone ClpB  66.9 
 
 
866 aa  1175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  9.23416e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2989  protein disaggregation chaperone  96.73 
 
 
857 aa  1684  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0921142  normal  0.947824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2772  protein disaggregation chaperone  96.73 
 
 
857 aa  1684  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.79848e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0570  ATP-dependent chaperone ClpB  57.31 
 
 
864 aa  979  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.483614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0413  ATP-dependent chaperone ClpB  57.13 
 
 
870 aa  953  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01442  ClpB protein  75.3 
 
 
824 aa  1271  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0453  ATP-dependent chaperone ClpB  64.73 
 
 
867 aa  1114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.17348e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2019  ATP-dependent chaperone ClpB  65.15 
 
 
865 aa  1132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1850  ATP-dependent Clp protease subunit  69.89 
 
 
861 aa  1221  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.808048  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10731  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  53.22 
 
 
863 aa  914  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.977517  normal  0.696601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4974  ATPase  57.44 
 
 
859 aa  959  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0120  ATPase  55 
 
 
863 aa  899  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.37349e-05 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  56.87 
 
 
871 aa  979  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  59.35 
 
 
862 aa  1010  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0229  ATPase  57.92 
 
 
870 aa  930  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  77.01 
 
 
857 aa  1352  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0886  protein disaggregation chaperone  87.4 
 
 
857 aa  1514  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.76912e-05  normal  0.0332416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3497  ATPase  76.18 
 
 
857 aa  1337  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.648443  normal  0.0100947 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2878  protein disaggregation chaperone  100 
 
 
857 aa  1733  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000852772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2750  protein disaggregation chaperone  100 
 
 
857 aa  1733  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.17665e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01007  hypothetical protein  76.66 
 
 
857 aa  1362  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0920  ATPase  58.31 
 
 
871 aa  966  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2015  ClpB  72.44 
 
 
859 aa  1248  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  59.3 
 
 
879 aa  1010  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1751  ATPase  58.96 
 
 
880 aa  1013  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1121  ATPase AAA-2 domain protein  78.18 
 
 
857 aa  1365  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0611865  normal  0.087173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3819  ATP-dependent chaperone ClpB  53.77 
 
 
861 aa  912  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0624258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5207  ATP-dependent chaperone ClpB  66.51 
 
 
870 aa  1137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5085  ATP-dependent chaperone ClpB  57.34 
 
 
878 aa  982  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1871  ATP-dependent chaperone ClpB  66.51 
 
 
865 aa  1168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  hitchhiker  0.00068735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3720  ATP-dependent chaperone ClpB  76.35 
 
 
857 aa  1348  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00907871  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  58.3 
 
 
874 aa  990  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4545  ATP-dependent chaperone ClpB  70.06 
 
 
854 aa  1214  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.822332  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  100 
 
 
857 aa  1733  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1089  protein disaggregation chaperone  100 
 
 
857 aa  1733  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.60565e-06  decreased coverage  6.35783e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3349  protein disaggregation chaperone  86.7 
 
 
857 aa  1506  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.33942e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0452  ATPase  56.79 
 
 
862 aa  943  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0991  ATP-dependent chaperone ClpB  57.8 
 
 
864 aa  993  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462361  normal  0.380293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0671  ATP-dependent chaperone ClpB  70.64 
 
 
854 aa  1201  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1077  ATPase  53.94 
 
 
866 aa  912  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2346  ATP-dependent chaperone ClpB  58.97 
 
 
874 aa  1005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.325239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3475  protein disaggregation chaperone  86.7 
 
 
857 aa  1506  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000223362  normal  0.392358 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0179  ATP-dependent chaperone ClpB  72.67 
 
 
859 aa  1251  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1426  ATP-dependent chaperone ClpB  66.63 
 
 
865 aa  1167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.814742  hitchhiker  0.00462707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1604  ATPase  52.98 
 
 
863 aa  909  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.234321  normal  0.194925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2309  ATP-dependent chaperone ClpB  56.61 
 
 
872 aa  988  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0234  ATP-dependent chaperone ClpB  56.27 
 
 
863 aa  919  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2465  ATP-dependent chaperone ClpB  56.94 
 
 
880 aa  929  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004392  ClpB protein  76.66 
 
 
857 aa  1364  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000934943  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4102  ATP-dependent chaperone ClpB  56.39 
 
 
850 aa  929  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5924  ATP-dependent chaperone ClpB  55.52 
 
 
880 aa  914  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2027  ATP-dependent chaperone ClpB  72.46 
 
 
860 aa  1254  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000180597  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1138  protein disaggregation chaperone  86.11 
 
 
858 aa  1506  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1601  ATP-dependent chaperone ClpB  55.81 
 
 
864 aa  896  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5193  ATP-dependent chaperone ClpB  56.4 
 
 
874 aa  934  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1858  ATP-dependent chaperone ClpB  55.15 
 
 
866 aa  935  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.17935e-08  normal  0.0630918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2007  ATP-dependent chaperone ClpB  54.44 
 
 
863 aa  938  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.324235  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3068  ATP-dependent chaperone ClpB  56.09 
 
 
887 aa  959  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0100  ATP-dependent chaperone ClpB  55.04 
 
 
860 aa  910  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.373648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2431  ATP-dependent chaperone ClpB  54.31 
 
 
865 aa  897  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.500769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0287  ATP-dependent chaperone ClpB  56.45 
 
 
864 aa  923  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00690  ATP-dependent chaperone ClpB  56.84 
 
 
871 aa  948  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1077  ATP-dependent chaperone ClpB  55.49 
 
 
871 aa  934  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.52857e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1216  ATP-dependent chaperone ClpB  58.39 
 
 
867 aa  970  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0525  ATPase AAA-2  55.61 
 
 
860 aa  934  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09888  putative heat shock ClpB protein  53.14 
 
 
893 aa  914  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0416  ATP-dependent chaperone ClpB  58.61 
 
 
855 aa  976  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0483677 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5467  ATP-dependent chaperone ClpB  55.99 
 
 
871 aa  930  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.184424  normal  0.486747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0243  ATP-dependent chaperone ClpB  56.76 
 
 
861 aa  946  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0494  ATP-dependent chaperone ClpB  56.42 
 
 
846 aa  947  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>