More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02444 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  99.75 
 
 
396 aa  824    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  99.75 
 
 
396 aa  823    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3037  nitric oxide dioxygenase  85.35 
 
 
396 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0829312  normal  0.336474 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2819  nitric oxide dioxygenase  91.41 
 
 
396 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214634  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  100 
 
 
396 aa  825    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2932  nitric oxide dioxygenase  91.41 
 
 
396 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384239  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  99.24 
 
 
396 aa  821    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2712  nitric oxide dioxygenase  90.91 
 
 
396 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2757  nitric oxide dioxygenase  91.41 
 
 
396 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.114719  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2798  nitric oxide dioxygenase  91.41 
 
 
396 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  66.92 
 
 
396 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  66.92 
 
 
396 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1092  globin  65.74 
 
 
395 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  64.65 
 
 
396 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1157  nitric oxide dioxygenase  63.38 
 
 
396 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0210523  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  63.13 
 
 
396 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  63.13 
 
 
396 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  62.12 
 
 
394 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  60.86 
 
 
394 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  60.61 
 
 
394 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  54.02 
 
 
397 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  54.43 
 
 
397 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  54.18 
 
 
397 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  54.43 
 
 
397 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  54.14 
 
 
397 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  54.14 
 
 
397 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  53.38 
 
 
397 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  52.72 
 
 
396 aa  411  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  51 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  50.25 
 
 
400 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  50.25 
 
 
398 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  51.12 
 
 
394 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  46.85 
 
 
402 aa  352  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  46.1 
 
 
402 aa  348  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  46.35 
 
 
402 aa  348  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  46.1 
 
 
402 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  43.64 
 
 
403 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  45.84 
 
 
402 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  45.59 
 
 
402 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  45.59 
 
 
402 aa  343  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  45.59 
 
 
402 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  45.59 
 
 
402 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  45.59 
 
 
402 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  45.34 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2544  nitric oxide dioxygenase  46.5 
 
 
411 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  42.75 
 
 
396 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  43 
 
 
400 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  42.61 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5615  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.64 
 
 
403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1689  nitric oxide dioxygenase  43.15 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47548  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0660  nitric oxide dioxygenase  42.89 
 
 
409 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  42.05 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  42.36 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.81 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2864  nitric oxide dioxygenase  42.5 
 
 
411 aa  299  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  42.61 
 
 
402 aa  298  9e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  42.61 
 
 
399 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  42.36 
 
 
402 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.1 
 
 
402 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  42 
 
 
414 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  42.36 
 
 
402 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  42.36 
 
 
402 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  42.36 
 
 
402 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  42.36 
 
 
402 aa  295  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0856  nitric oxide dioxygenase  41.9 
 
 
409 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0598047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  42.75 
 
 
392 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  42.5 
 
 
392 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  42.11 
 
 
402 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  42.11 
 
 
402 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  41.6 
 
 
402 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.1 
 
 
402 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.85 
 
 
402 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  41.1 
 
 
402 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3580  nitric oxide dioxygenase  42.18 
 
 
393 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.824868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3173  nitric oxide dioxygenase  40.36 
 
 
403 aa  290  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0933  nitric oxide dioxygenase  43.28 
 
 
414 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  42 
 
 
392 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2535  nitric oxide dioxygenase  41.54 
 
 
393 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4378  nitric oxide dioxygenase  42 
 
 
392 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  41.65 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0190  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.94 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0969  nitric oxide dioxygenase  43.28 
 
 
423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.137694  normal  0.0138657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4026  nitric oxide dioxygenase  40.9 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.874831  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3643  nitric oxide dioxygenase  41.15 
 
 
413 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.099034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1304  nitric oxide dioxygenase  42.57 
 
 
393 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  42.79 
 
 
393 aa  279  8e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0036  nitric oxide dioxygenase  39.49 
 
 
397 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0192544  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.65 
 
 
428 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0044  nitric oxide dioxygenase  39.49 
 
 
397 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.534216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3408  nitric oxide dioxygenase  42.57 
 
 
393 aa  277  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5676  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.5 
 
 
408 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.380309  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29640  nitric oxide dioxygenase  40.55 
 
 
393 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  41.35 
 
 
395 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6324  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.65 
 
 
394 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  43 
 
 
419 aa  276  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>