More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02373 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02373  hydrogenase 4, 4Fe-4S subunit  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02335  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  420  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  99.51 
 
 
205 aa  417  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2613  hydrogenase-4 component A  98.54 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1188  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  98.05 
 
 
205 aa  411  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2763  iron-sulfur cluster-binding protein  98.05 
 
 
205 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2628  hydrogenase-4 component A  96.59 
 
 
205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.493395  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2853  hydrogenase-4 component A  95.12 
 
 
205 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3703  hydrogenase-4 component A  95.61 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1286  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.97 
 
 
208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.242338  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.58 
 
 
208 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2433  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  51.61 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02574  hydrogenase 3, Fe-S subunit  50.81 
 
 
203 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02539  hypothetical protein  50.81 
 
 
203 aa  191  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.02 
 
 
202 aa  191  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3055  formate hydrogenlyase subunit B  50.81 
 
 
202 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.322322  normal  0.143853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2973  formate hydrogenlyase, subunit B  50.81 
 
 
202 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3004  formate hydrogenlyase subunit B  50.81 
 
 
202 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3162  formate hydrogenlyase, subunit B  50.81 
 
 
202 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.263749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3039  formate hydrogenlyase subunit B  50.81 
 
 
202 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00075265 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50.27 
 
 
203 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3975  formate hydrogenlyase, subunit B  49.73 
 
 
203 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0988  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.27 
 
 
203 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.222479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2860  formate hydrogenlyase, subunit B  50.27 
 
 
203 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2849  formate hydrogenlyase, subunit B  50.27 
 
 
203 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.299991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3152  formate hydrogenlyase, subunit B  49.19 
 
 
203 aa  187  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3012  formate hydrogenlyase, subunit B  49.19 
 
 
203 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4576  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  49.48 
 
 
205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00930  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  48.68 
 
 
199 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  48.65 
 
 
189 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2858  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.5 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.874792 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.93 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0122897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.86 
 
 
173 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0323  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.32 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1269  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.9 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3683  iron-sulfur cluster-binding protein  38.5 
 
 
185 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.5 
 
 
185 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0730  4Fe-4S ferrodoxin  38.5 
 
 
185 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.503166  normal  0.464692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4577  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.59 
 
 
188 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4597  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.37 
 
 
169 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4598  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.69 
 
 
674 aa  121  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0474  electron transport protein  40 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  38.02 
 
 
667 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4278  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.69 
 
 
674 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.27 
 
 
176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7476  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1884  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.41 
 
 
176 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1792  electron transport protein HydN  33.68 
 
 
189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.288357  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1915  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.02 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2963  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  34.72 
 
 
658 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4011  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.26 
 
 
671 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02680  hypothetical protein  36.63 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3211  4Fe-4S binding protein  36.63 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.624865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3045  4Fe-4S binding protein  36.63 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3018  4Fe-4S binding protein  36.63 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0823  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.63 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02719  fused predicted oxidoreductase: Fe-S subunit/nucleotide-binding subunit  33.5 
 
 
639 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.645613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0806  glutamate synthase, small subunit  33.5 
 
 
639 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3046  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.5 
 
 
639 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3689  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3212  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.5 
 
 
639 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.845239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0822  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.5 
 
 
639 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4176  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33.5 
 
 
641 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.623364  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02359  fused predicted oxidoreductase: FeS binding subunit/NAD/FAD-binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  37.77 
 
 
659 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2597  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1209  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2747  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.77 
 
 
659 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  37.77 
 
 
659 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.14 
 
 
162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2623  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.17 
 
 
653 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.17 
 
 
653 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2738  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  36.17 
 
 
653 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3019  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  33 
 
 
644 aa  111  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2845  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.64 
 
 
653 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.625431  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.64 
 
 
653 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2425  electron transport protein HydN  34.54 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3186  electron transport protein HydN  35.2 
 
 
181 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02563  formate dehydrogenase-H, [4Fe-4S] ferredoxin subunit  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0976  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.961546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2836  electron transport protein HydN  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0600195 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0999  electron transport protein HydN  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02528  hypothetical protein  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3896  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.85 
 
 
157 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3164  electron transport protein HydN  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2997  electron transport protein HydN  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2849  electron transport protein HydN  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3963  electron transport protein HydN  34.67 
 
 
175 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4050  hypothetical protein  35.79 
 
 
157 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3989  hypothetical protein  35.79 
 
 
157 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3880  protein AegA  35.79 
 
 
157 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3777  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 
157 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4949  4Fe-4S binding domain protein  33.68 
 
 
157 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.773507 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1861  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.89 
 
 
212 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000613847  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4070  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.68 
 
 
157 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0133  hydrogenase-3 small subunit  32.97 
 
 
211 aa  104  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.952197  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00910  Fe-S-cluster-containing hydrogenase subunit  37.57 
 
 
177 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3864  protein AegA  35.26 
 
 
157 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3944  oxidoreductase AegA  35.79 
 
 
157 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.716266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>