More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02323 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02323  sulfate/thiosulfate transporter subunit  100 
 
 
149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1238  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
291 aa  302  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.848072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02284  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  302  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2709  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  302  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2795  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1256  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  302  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000285694 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2559  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  100 
 
 
291 aa  302  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2578  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.33 
 
 
291 aa  300  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2808  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.33 
 
 
291 aa  300  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2678  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.33 
 
 
291 aa  300  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2636  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.33 
 
 
291 aa  299  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.399636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2587  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.33 
 
 
291 aa  299  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3653  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  99.33 
 
 
291 aa  299  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2702  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  98.66 
 
 
291 aa  298  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2949  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  94.63 
 
 
291 aa  287  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.540526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3455  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  89.26 
 
 
291 aa  273  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1301  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  87.92 
 
 
291 aa  271  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1410  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  87.92 
 
 
291 aa  271  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2767  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  87.92 
 
 
291 aa  271  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.774717  hitchhiker  0.00253769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0767  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  82.86 
 
 
288 aa  244  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1004  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  80.71 
 
 
288 aa  239  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0078  sulfate/thiosulfate transporter permease subunit  76.98 
 
 
280 aa  219  8e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.94391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1371  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.58 
 
 
285 aa  207  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1182  sulfate ABC transporter, permease protein  61.38 
 
 
295 aa  192  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.27298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0650  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.54 
 
 
296 aa  191  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357355  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4316  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  61.97 
 
 
275 aa  190  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.356778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1064  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.14 
 
 
288 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0995  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.4 
 
 
288 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.91629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3014  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.4 
 
 
289 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0486489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3094  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.4 
 
 
289 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3191  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.4 
 
 
289 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3294  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.4 
 
 
288 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.374167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3601  sulfate ABC transporter, permease protein  66.17 
 
 
289 aa  184  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2959  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.99 
 
 
297 aa  181  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1003  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.67 
 
 
289 aa  181  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.188102  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1800  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.66 
 
 
275 aa  180  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1545  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.34 
 
 
302 aa  180  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2378  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  56.64 
 
 
339 aa  178  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1097  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.06 
 
 
288 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.232742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1013  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.7 
 
 
285 aa  177  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2074  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.9 
 
 
277 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0230332  hitchhiker  6.41396e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3892  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.86 
 
 
294 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1198  sulfate ABC transporter, permease protein  57.97 
 
 
285 aa  176  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3092  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  56.38 
 
 
293 aa  177  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1127  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  57.97 
 
 
285 aa  176  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0125  ABC type transporter  57.93 
 
 
304 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000364812 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0067  sulfate ABC transporter, permease protein  61.07 
 
 
287 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5391  sulfate ABC transporter permease protein CysW  60.56 
 
 
289 aa  174  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.93873  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0583  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.58 
 
 
300 aa  174  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.501211  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0610  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  55.78 
 
 
298 aa  174  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1098  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.58 
 
 
293 aa  174  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0558  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.58 
 
 
300 aa  174  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0594  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.58 
 
 
300 aa  174  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472245 
 
 
-
 
NC_004310  BR1328  sulfate ABC transporter, permease protein  63.36 
 
 
276 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00185073  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1288  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  63.36 
 
 
276 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.749605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2533  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  56.83 
 
 
294 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00678647  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6975  sulfate/thiosulfate permease W  55.7 
 
 
301 aa  169  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.85 
 
 
274 aa  169  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.85 
 
 
274 aa  169  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4116  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.71 
 
 
286 aa  169  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.943743  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1640  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.85 
 
 
319 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259928  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2064  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.91 
 
 
291 aa  166  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.409607  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3691  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60.58 
 
 
287 aa  165  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3331  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  70 
 
 
267 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668097  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1285  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.91 
 
 
328 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1222  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.91 
 
 
326 aa  163  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.917674  normal  0.204361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1185  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  57.05 
 
 
293 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1969  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  59.72 
 
 
307 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0792  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  62.04 
 
 
288 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3755  hypothetical protein  62.04 
 
 
288 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1554  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  50.68 
 
 
289 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3558  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  54.55 
 
 
292 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4588  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  60.99 
 
 
335 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4020  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  61.15 
 
 
290 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  0.19248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1377  sulfate ABC transporter permease protein CysW  60.56 
 
 
305 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1046  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  55.7 
 
 
294 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1627  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  64.04 
 
 
334 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21378  normal  0.486831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4347  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.03 
 
 
290 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1775  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  63.16 
 
 
350 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0521176  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0106  sulfate ABC transporter, permease protein CysW  59.85 
 
 
288 aa  160  7e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0109  sulfate ABC transporter, permease protein  59.85 
 
 
288 aa  160  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4654  sulfate ABC transporter, permease protein  53.96 
 
 
283 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2547  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.44 
 
 
315 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5169  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.78 
 
 
290 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1346  putative sulfate transport ABC transporter protein  62.41 
 
 
326 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525914  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1760  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  57.45 
 
 
288 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.595537  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2468  ABC sulfate/thiosulfate transporter, innermembrane subunit, CysW  63.16 
 
 
346 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.579343  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2801  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  56.38 
 
 
294 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0293  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.78 
 
 
290 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.500562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1634  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  68.57 
 
 
315 aa  158  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5229  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  58.78 
 
 
290 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.587413  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0372  sulfate transport protein CysW  59.03 
 
 
288 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2478  sulfate ABC transporter, permease protein  68.57 
 
 
340 aa  157  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03670  sulfate transport protein CysW  59.03 
 
 
289 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0616363  hitchhiker  0.00000000687295 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0122  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  59.12 
 
 
294 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1685  sulphate transport system permease protein 2  56.12 
 
 
286 aa  157  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.253775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4008  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  60 
 
 
298 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3434  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  67.62 
 
 
279 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.384691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4741  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  67.62 
 
 
316 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00402264  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3184  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  54.48 
 
 
289 aa  157  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0224874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>