More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02084 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  100 
 
 
663 aa  1366    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  99.85 
 
 
663 aa  1364    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  98.79 
 
 
659 aa  1343    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  99.85 
 
 
663 aa  1364    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  87.85 
 
 
650 aa  1209    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  87.69 
 
 
650 aa  1209    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  81.45 
 
 
656 aa  1126    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  87.54 
 
 
650 aa  1206    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  99.7 
 
 
663 aa  1363    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  88 
 
 
650 aa  1211    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  99.85 
 
 
663 aa  1364    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  99.38 
 
 
641 aa  1309    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  100 
 
 
663 aa  1366    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  87.54 
 
 
650 aa  1207    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  36.64 
 
 
653 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  37.39 
 
 
653 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  37.12 
 
 
666 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  36.76 
 
 
635 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  37.02 
 
 
666 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  38.37 
 
 
665 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  38.37 
 
 
665 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  37.3 
 
 
666 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  38.22 
 
 
665 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  37.52 
 
 
666 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  37.52 
 
 
666 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  36.51 
 
 
663 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.88 
 
 
665 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  36.21 
 
 
663 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 
740 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  36.02 
 
 
652 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  35.09 
 
 
658 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  35.4 
 
 
656 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  35.18 
 
 
649 aa  349  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  35.85 
 
 
657 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  36.93 
 
 
648 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 
743 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 
726 aa  342  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  36.95 
 
 
652 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  32.99 
 
 
655 aa  339  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 
661 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 
681 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 
665 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 
653 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  34.31 
 
 
640 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 
649 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 
649 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 
662 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  34.76 
 
 
742 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  35.22 
 
 
662 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  35.07 
 
 
680 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  33.52 
 
 
702 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  34.67 
 
 
742 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  34.66 
 
 
662 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  34.06 
 
 
724 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.12 
 
 
700 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  33.93 
 
 
724 aa  314  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  33.79 
 
 
724 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  33.79 
 
 
724 aa  313  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.69 
 
 
732 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  33.19 
 
 
698 aa  311  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  33.29 
 
 
724 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 
698 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 
698 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 
698 aa  310  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  33.8 
 
 
714 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 
799 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
799 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 
799 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  32.24 
 
 
746 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  31.94 
 
 
746 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 
650 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  32.02 
 
 
746 aa  289  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.56 
 
 
695 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  31.36 
 
 
740 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  31.33 
 
 
703 aa  282  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  31.17 
 
 
746 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.73 
 
 
696 aa  280  6e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.97 
 
 
696 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  31.31 
 
 
676 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 
806 aa  279  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  31.66 
 
 
744 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  31.49 
 
 
757 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  33.38 
 
 
680 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 
713 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  31.11 
 
 
744 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  32.16 
 
 
751 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  32.03 
 
 
751 aa  274  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  32.03 
 
 
751 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  32.03 
 
 
751 aa  273  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  32.61 
 
 
572 aa  273  9e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  31.56 
 
 
744 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  31.64 
 
 
751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  32.44 
 
 
746 aa  270  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  32.31 
 
 
746 aa  270  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  32.31 
 
 
746 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  32.31 
 
 
746 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  32.44 
 
 
746 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  32.44 
 
 
746 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  32.17 
 
 
746 aa  269  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  31.73 
 
 
746 aa  269  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>