180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01812 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  99.19 
 
 		 124 aa  254  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  99.19 
 
 		 124 aa  254  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  99.19 
 
 		 124 aa  254  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  98.39 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  96.77 
 
 		 124 aa  248  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  74.19 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  75 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  74.19 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  74.19 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  74.19 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  50.82 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  50.82 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  50.82 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  48.28 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  68.82 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  41.94 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  45.16 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  41.46 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  40.34 
 
 		 119 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  38.94 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  43.7 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  41.03 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  39.32 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  41.41 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  38.84 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  39.32 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  39.32 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  43.52 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  39.13 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  40.52 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  41.32 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  39.22 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  35.96 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  36.67 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  36.67 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  37.76 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 590 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  41.03 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  34.92 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.51 
 
 		 613 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  32.43 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  38.39 
 
 		 869 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  31.09 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 593 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 564 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  42 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 565 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 560 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  34.26 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  44.55 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  26.55 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  26.55 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  31.46 
 
 		 578 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 697 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  26.55 
 
 		 547 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  26.55 
 
 		 544 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  36.96 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  34.48 
 
 		 519 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  26.42 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.9 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>