31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01637 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01637  conserved protein with FAD/NAD(P)-binding domain  100 
 
 
534 aa  1106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.395296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1963  hypothetical protein  98.69 
 
 
534 aa  1091  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  3.0745e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1749  hypothetical protein  98.69 
 
 
534 aa  1091  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.14791e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01627  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373231  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1782  hypothetical protein  70.04 
 
 
536 aa  792  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2381  hypothetical protein  98.88 
 
 
534 aa  1092  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  7.1971e-05  hitchhiker  0.00180659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1974  conserved hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000437192  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3875  hypothetical protein  52.69 
 
 
534 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.408121  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3137  hypothetical protein  52.59 
 
 
534 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2356  hypothetical protein  27.25 
 
 
578 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3130  hypothetical protein  27.58 
 
 
572 aa  186  1e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1824  hypothetical protein  29.68 
 
 
582 aa  180  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000311233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1868  FAD dependent oxidoreductase  98.82 
 
 
85 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.189334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0206  hypothetical protein  25.99 
 
 
580 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5540  hypothetical protein  26.72 
 
 
506 aa  59.7  1e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.621882  normal  0.230055 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1329  hypothetical protein  21.7 
 
 
494 aa  53.9  8e-06  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.230961  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3022  hypothetical protein  22.96 
 
 
507 aa  52.8  1e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0268135  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3530  hypothetical protein  24.43 
 
 
445 aa  52  3e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5543  hypothetical protein  23.17 
 
 
490 aa  50.4  8e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5118  hypothetical protein  24.6 
 
 
444 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.917814  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3277  hydroxyacylglutathione hydrolase  21.86 
 
 
443 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3286  hypothetical protein  25.82 
 
 
466 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.162486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1051  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family  24.5 
 
 
474 aa  47.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.169159 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1859  hypothetical protein  19.47 
 
 
500 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1824  hypothetical protein  19.47 
 
 
500 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0763  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 
455 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2537  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.93 
 
 
1072 aa  44.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0065  hypothetical protein  21.89 
 
 
473 aa  44.3  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  30.77 
 
 
624 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1700  StAR  21 
 
 
479 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.91604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1779  hypothetical protein  23.01 
 
 
474 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>