More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01278 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
426 aa  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
426 aa  878    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  878    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  99.53 
 
 
426 aa  875    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  69.34 
 
 
427 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  77.93 
 
 
426 aa  714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  99.06 
 
 
426 aa  872    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  100 
 
 
426 aa  878    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  99.77 
 
 
426 aa  877    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  99.06 
 
 
426 aa  868    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  99.53 
 
 
426 aa  875    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  67.92 
 
 
428 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  67.92 
 
 
428 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  67.69 
 
 
428 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  67.22 
 
 
428 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  66.04 
 
 
428 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  65.8 
 
 
428 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  66.04 
 
 
428 aa  591  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  65.57 
 
 
428 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  66.2 
 
 
428 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  65.02 
 
 
428 aa  589  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  65.88 
 
 
427 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  65.88 
 
 
427 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  65.8 
 
 
428 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  65.09 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  65.33 
 
 
427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  65.09 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  65.09 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  65.73 
 
 
428 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  65.33 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  62.91 
 
 
440 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  65.57 
 
 
427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  64.24 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  62.91 
 
 
428 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  61.56 
 
 
428 aa  564  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  63.29 
 
 
427 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  61.23 
 
 
427 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  61.58 
 
 
428 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
433 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  54.61 
 
 
427 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  51.77 
 
 
436 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  45.33 
 
 
431 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  46.03 
 
 
439 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  47.52 
 
 
423 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  45.79 
 
 
439 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 
431 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 
431 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
435 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  45.15 
 
 
438 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 
437 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  44.81 
 
 
437 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  44.34 
 
 
437 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 
431 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  44.21 
 
 
430 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 
436 aa  362  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 
429 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 
435 aa  360  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  42.32 
 
 
435 aa  359  5e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  44.68 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 
435 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
435 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 
434 aa  352  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  41.37 
 
 
435 aa  352  8e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
435 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 
435 aa  351  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  44.58 
 
 
430 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  44.71 
 
 
433 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  42.89 
 
 
449 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  43.97 
 
 
430 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
435 aa  350  4e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  43.97 
 
 
430 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  43.97 
 
 
430 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
435 aa  349  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
435 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 
435 aa  346  4e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  43.4 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 
433 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 
433 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  42.59 
 
 
433 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
430 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 
437 aa  332  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 
430 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 
433 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 
433 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 
433 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 
433 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 
424 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 
437 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
437 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 
419 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
429 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 
433 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>