165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01257 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  803  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.60117e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  77.84 
 
 
389 aa  647  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.15898e-08  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
389 aa  803  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.56513e-08  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
389 aa  803  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.93572e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  78.09 
 
 
389 aa  648  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  4.81977e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  78.09 
 
 
389 aa  648  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.87285e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1441  tetratricopeptide repeat protein  93.4 
 
 
389 aa  725  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.53911e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  80.74 
 
 
389 aa  654  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.74406e-08  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1837  tetratricopeptide repeat protein  93.4 
 
 
389 aa  725  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.2719e-06  hitchhiker  0.000343343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1895  tetratricopeptide repeat protein  93.14 
 
 
389 aa  723  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000228715  hitchhiker  4.98218e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1832  tetratricopeptide repeat protein  93.4 
 
 
389 aa  725  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00100254  unclonable  2.05101e-30 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
389 aa  803  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  4.55068e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
389 aa  803  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.45858e-09  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
389 aa  803  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.76435e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
389 aa  803  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.51113e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
389 aa  803  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.29079e-07  unclonable  2.38916e-08 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1622  tetratricopeptide repeat protein  93.4 
 
 
389 aa  725  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000649442  decreased coverage  2.66656e-22 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  803  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.97215e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  89.18 
 
 
389 aa  715  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  1.46225e-05  hitchhiker  5.69887e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2641  tetratricopeptide repeat protein  75.2 
 
 
389 aa  616  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  5.90844e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2367  tetratricopeptide repeat protein  75.73 
 
 
389 aa  616  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1735  tetratricopeptide repeat protein  72.03 
 
 
389 aa  597  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  2.33751e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1702  tetratricopeptide repeat protein  72.56 
 
 
389 aa  595  1e-169  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.18527e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  53.35 
 
 
389 aa  455  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.8122e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  51.71 
 
 
391 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  51.19 
 
 
389 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  8.11789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  50 
 
 
373 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.20972e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0973  tetratricopeptide repeat protein  45.1 
 
 
398 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  5.17245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2314  tetratricopeptide repeat protein  46.02 
 
 
386 aa  362  5e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.83744e-06  hitchhiker  3.79293e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  45.88 
 
 
386 aa  360  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  46.79 
 
 
390 aa  358  8e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  43.81 
 
 
386 aa  357  2e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  1.17137e-10 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  44.87 
 
 
386 aa  356  3e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.00726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  46.39 
 
 
386 aa  356  3e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.14151e-08  unclonable  4.55272e-11 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1756  tetratricopeptide repeat protein  44.59 
 
 
386 aa  356  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.0151e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  45.36 
 
 
386 aa  355  6e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.79744e-06  hitchhiker  5.58993e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2051  tetratricopeptide repeat protein  46.39 
 
 
386 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.58235e-06  unclonable  3.09501e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1980  tetratricopeptide repeat protein  46.39 
 
 
386 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  7.627e-08  unclonable  7.27651e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  45.36 
 
 
386 aa  352  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  5.1e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  45.62 
 
 
386 aa  352  9e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.65574e-06  unclonable  2.85968e-12 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  43.81 
 
 
386 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  4.10522e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  45.62 
 
 
386 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  7.29266e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  45.36 
 
 
386 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.87508e-07  unclonable  1.14116e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  45.36 
 
 
386 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.64995e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  43.81 
 
 
386 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.05333e-06  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  40.36 
 
 
389 aa  321  1e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  40.36 
 
 
389 aa  320  2e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  37.89 
 
 
389 aa  313  3e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  40.52 
 
 
388 aa  312  5e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.32586e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  40.52 
 
 
389 aa  310  3e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  39.32 
 
 
389 aa  300  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  3.01038e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  38.38 
 
 
389 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  1.28021e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  40.2 
 
 
389 aa  284  2e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  39.05 
 
 
392 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  38.12 
 
 
389 aa  275  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  39.47 
 
 
392 aa  275  1e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  38.26 
 
 
392 aa  272  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  39.01 
 
 
391 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 
397 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  37.2 
 
 
390 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  37.76 
 
 
387 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  37.73 
 
 
392 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  38.26 
 
 
390 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  36.94 
 
 
391 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  37.73 
 
 
390 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  37.73 
 
 
390 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  37.73 
 
 
390 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  37.97 
 
 
390 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  36.68 
 
 
391 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
392 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  37.99 
 
 
390 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  37.01 
 
 
390 aa  242  8e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2154  tetratricopeptide repeat protein  36.36 
 
 
394 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  240  3e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  240  3e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  240  3e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  240  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  240  3e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  240  3e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  35.88 
 
 
389 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  36.56 
 
 
391 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0959  tetratricopeptide repeat protein  35.04 
 
 
394 aa  221  2e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214004  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  31.8 
 
 
425 aa  219  8e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  31.14 
 
 
424 aa  214  2e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  31.14 
 
 
424 aa  214  2e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  30.5 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  30.5 
 
 
387 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2138  tetratricopeptide repeat protein  32.82 
 
 
401 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00930218  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  32.68 
 
 
409 aa  198  2e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  31.51 
 
 
407 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  33.25 
 
 
408 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  32.23 
 
 
403 aa  193  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  32.13 
 
 
403 aa  189  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  2.92633e-06 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0906  hypothetical protein  29.84 
 
 
384 aa  184  2e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330727  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1027  hypothetical protein  29.84 
 
 
385 aa  184  2e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000719629  unclonable  4.01052e-11 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2247  tetratricopeptide repeat protein  31.88 
 
 
389 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  32.55 
 
 
384 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1030  tetratricopeptide repeat protein  30.23 
 
 
390 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.457607  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2472  tetratricopeptide repeat protein  30.87 
 
 
385 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.3368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>