42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00989 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00989  predicted outer membrane lipoprotein  100 
 
 
214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00996  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2657  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  99.53 
 
 
214 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2329  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  99.53 
 
 
214 aa  441  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2610  putative regulator  99.53 
 
 
214 aa  441  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.283606 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1102  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  99.53 
 
 
214 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1096  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  99.53 
 
 
214 aa  441  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1222  group 4 capsule (G4C) polysaccharide, lipoprotein YmcC  98.13 
 
 
214 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000233631  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03899  predicted lipoprotein  38.68 
 
 
212 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03859  hypothetical protein  38.68 
 
 
212 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4003  hypothetical protein  38.68 
 
 
212 aa  160  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.401316 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3970  conserved hypothetical protein  38.68 
 
 
212 aa  160  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0232  lipoprotein  39.62 
 
 
212 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.231954  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4266  hypothetical protein  38.68 
 
 
222 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4575  hypothetical protein  38.68 
 
 
222 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4488  hypothetical protein  38.21 
 
 
212 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4617  hypothetical protein  39.39 
 
 
212 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5506  hypothetical protein  38.21 
 
 
212 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4565  hypothetical protein  39.39 
 
 
212 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.574864  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4414  hypothetical protein  38.89 
 
 
212 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0127053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4565  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0399396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4480  hypothetical protein  38.38 
 
 
212 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4532  hypothetical protein  42.39 
 
 
232 aa  154  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1322  putative lipoprotein  32.71 
 
 
225 aa  118  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00089684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2845  putative lipoprotein  32.86 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3157  putative lipoprotein  32.13 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2861  putative lipoprotein  30.8 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000231875  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1342  putative lipoprotein  31.14 
 
 
236 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0028358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1395  putative lipoprotein  31.16 
 
 
236 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.19041  normal  0.0366327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1407  putative lipoprotein  30.7 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3012  putative lipoprotein  30.23 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000028974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3007  putative lipoprotein  30.36 
 
 
235 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000100687  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0274  putative lipoprotein  29.86 
 
 
221 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2521  putative lipoprotein  29.06 
 
 
236 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.43848  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1498  lipoprotein, putative  28.76 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000176994  normal  0.35232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00685  hypothetical protein  32.84 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2878  putative lipoprotein  28.76 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000189272  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3202  hypothetical protein  25.81 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.210249  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001789  hypothetical protein  29.41 
 
 
226 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0791  putative regulator  26.99 
 
 
234 aa  68.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000259284  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00051  putative lipoprotein  22.9 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0750623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3832  hypothetical protein  23.08 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.573259  normal  0.373184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>